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Gene

LRRC45

leucine rich repeat containing 45

Resumo

Localização citogenética
17q25.3
Coordenadas
Cromossoma 17: 82 023 305–82 031 151 (GRCh38)
Exões
17 exões ao longo de 7,8 kb
Proteína
670 aminoácidos
Também conhecido como
MGC20806
Transcrito MANE Select
ENST00000306688.8NM_144999.4
Tipo de locus
Codificantes de proteínas
  • Muito elevada
  • Confiável
  • Baixa
  • Muito baixa

Relatórios com curadoria relevantes para este gene

Nenhum relatório do Genome Test analisa LRRC45 ainda. O teste sequencia todo o seu genoma, pelo que os seus dados o incluem igualmente.

Como LRRC45 está organizado

  • Sequência codificante
  • Região não traduzida
  • Intrão
  • Sentido da transcrição
Cromossoma 17, com um parêntese onde se situa LRRC45. LRRC45 e 46 genes próximos no cromossoma 17, de 81 527 228 a 82 527 227.Cromossoma 1717q25.3p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.381,6 Mb81,8 Mb82 Mb82,2 Mb82,4 MbFSCN2: 81 528 372–81 542 415, fita diretaFSCN2FAAP100: 81 539 885–81 553 961, fita inversaFAAP100NPLOC4: 81 556 887–81 648 465, fita inversaNPLOC4TSPAN10: 81 637 171–81 648 754, fita diretaPDE6G: 81 650 459–81 663 112, fita inversaOXLD1: 81 665 033–81 666 635, fita inversaCCDC137: 81 666 698–81 673 904, fita diretaARL16: 81 681 160–81 683 797, fita inversaHGS: 81 683 326–81 703 138, fita diretaHGSMRPL12: 81 703 357–81 711 112, fita diretaMRPL12: 81 703 371–81 720 539, fita diretaSLC25A10: 81 711 951–81 721 969, fita diretaSLC25A10GCGR: 81 803 105–81 814 023, fita diretaGCGRMCRIP1: 81 821 790–81 833 302, fita inversaMCRIP1PPP1R27: 81 833 488–81 835 056, fita inversaPPP1R27P4HB: 81 843 158–81 860 856, fita inversaP4HBARHGDIA: 81 867 719–81 871 378, fita inversaALYREF: 81 887 830–81 891 835, fita inversaANAPC11: 81 890 669–81 900 991, fita diretaNPB: 81 900 745–81 902 905, fita diretaPCYT2: 81 900 958–81 911 507, fita inversaSIRT7: 81 911 939–81 921 323, fita inversaMAFG: 81 918 270–81 927 769, fita inversaMAFGPYCR1: 81 932 378–81 942 412, fita inversaPYCR1MYADML2: 81 939 645–81 947 233, fita inversaMYADML2NOTUM: 81 952 507–81 963 328, fita inversaNOTUMASPSCR1: 81 976 807–82 018 698, fita diretaCENPX: 82 018 590–82 024 107, fita inversaCENPXLRRC45: 82 023 305–82 031 151, fita diretaLRRC45RAC3: 82 031 192–82 034 218, fita diretaRAC3DCXR: 82 035 136–82 037 777, fita inversaDCXRRFNG: 82 047 902–82 051 871, fita inversaGPS1: 82 050 691–82 058 063, fita diretaDUS1L: 82 057 506–82 066 206, fita inversaFASN: 82 076 900–82 098 294, fita inversaFASNCCDC57: 82 101 458–82 212 885, fita inversaCCDC57SLC16A3: 82 217 878–82 261 176, fita diretaSLC16A3CSNK1D: 82 239 023–82 273 730, fita inversaCSNK1DCD7: 82 313 564–82 317 625, fita inversaCD7SECTM1: 82 321 024–82 335 518, fita inversaSECTM1TEX19: 82 359 246–82 363 775, fita diretaTEX19UTS2R: 82 368 266–82 377 709, fita diretaUTS2ROGFOD3: 82 389 210–82 418 637, fita inversaOGFOD3HEXD: 82 418 318–82 442 647, fita diretaHEXDCYBC1: 82 440 351–82 450 829, fita inversaCYBC1NARF: 82 458 180–82 490 542, fita diretaNARFFOXK2: 82 519 248–82 644 662, fita diretaFOXK2Diagrama de LRRC45: 17 exões na cadeia direta do cromossoma 17Exão 1: 82 023 305–82 023 863, 559 basesExão 2: 82 024 278–82 024 339, 62 basesExão 3: 82 024 693–82 024 763, 71 basesExão 4: 82 025 000–82 025 178, 179 basesExão 5: 82 025 379–82 025 507, 129 basesExão 6: 82 026 899–82 027 011, 113 basesExão 7: 82 027 386–82 027 444, 59 basesExão 8: 82 027 674–82 027 751, 78 basesExão 9: 82 028 011–82 028 146, 136 basesExão 10: 82 028 234–82 028 311, 78 basesExão 11: 82 028 397–82 028 508, 112 basesExão 12: 82 028 613–82 028 683, 71 basesExão 13: 82 029 093–82 029 185, 93 basesExão 14: 82 029 543–82 029 635, 93 basesExão 15: 82 030 065–82 030 238, 174 basesExão 16: 82 030 319–82 030 466, 148 basesExão 17: 82 030 609–82 031 151, 543 bases1246810121416175′3′

Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.

Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).

Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.

Os exões representam 2,7 kb dos 7,8 kb do gene; 2013 dessas bases codificam a proteína.

Sequenciação de LRRC45

16Moderado

Grau de dificuldade de sequenciar LRRC45 com leituras curtas, numa escala de 0 a 100

Alguns dos exões de LRRC45 se situam em zonas onde as leituras curtas podem falhar ou posicionar mal uma alteração.

O que acresce: a proporção dos exões de LRRC45 em cada tipo de região difícil

  • Mapeabilidade0%
  • Homologia0%
  • Partilhado com o chrY0%
  • Cobertura da referência0%
  • Repetições2,1%
  • Conteúdo em GC77%

Uma pontuação da Dante Labs baseada na nossa própria investigação, construída a partir dos mapas de regiões difíceis de sequenciar Genome in a Bottle do NIST.Como é calculada a pontuação

Ligações externas

De onde vem isto

  • HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
  • MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
  • As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gene LRRC45: leucine rich repeat containing 45. Consultado em 20 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/lrrc45

Vancouver

Dante Labs. Gene LRRC45: leucine rich repeat containing 45 [Internet]. [consultado em 20 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/lrrc45

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