Hopp til innhold
Bruk midlene fra HSA eller FSA

Gen

CAST

calpastatin

Sammendrag

Cytogenetisk plassering
5q15
Koordinater
Kromosom 5: 96 662 376–96 774 683 (GRCh38)
Eksoner
32 eksoner over 112,3 kb
Protein
791 aminosyrer
Tidligere symboler
MIR583HG
MANE Select-transkripsjon
ENST00000675179.1NM_001750.7
Lokustype
gene with protein product
  • Svært høy
  • Sikker
  • Lav
  • Svært lav

ReferansegenomGRCh38

Posisjoner på gen- og variantsidene følger dette valget i denne nettleseren.

Kuraterte rapporter som er relevante for dette genet

Ingen Genome Test-rapport leser CAST ennå. Testen sekvenserer hele genomet ditt, så dataene dine inkluderer det likevel.

Slik er CAST bygget opp

  • Kodende sekvens
  • Utranslatert region
  • Intron
  • Transkripsjonsretning
  • Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
  • Områder som korte avlesninger sliter med
Kromosom 5, med en parentes der CAST står. CAST og 6 gener i nærheten på kromosom 5, fra 96 218 530 til 97 218 529.Kromosom 55q15p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.396,4 Mb96,6 Mb96,8 Mb97 Mb97,2 MbPCSK1: 96 390 333–96 434 143, bakover-strengPCSK1CAST: 96 662 376–96 774 683, fremover-strengCASTERAP1: 96 759 649–96 808 177, bakover-strengERAP1ERAP2: 96 875 979–96 919 703, fremover-strengERAP2LNPEP: 96 934 807–97 037 513, fremover-strengLNPEPLIX1: 97 091 867–97 142 846, bakover-strengLIX1RIOK2: 97 160 867–97 183 297, bakover-strengRIOK2Diagram av CAST: 32 eksoner på fremover-strengen til kromosom 5Ekson 5: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 16: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 25: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 1: 96 662 376–96 662 497, 122 baserEkson 2: 96 675 539–96 675 601, 63 baserEkson 3: 96 695 836–96 695 907, 72 baserEkson 4: 96 722 639–96 722 698, 60 baserEkson 5: 96 726 794–96 726 859, 66 baserEkson 6: 96 727 489–96 727 530, 42 baserEkson 7: 96 729 153–96 729 209, 57 baserEkson 8: 96 729 612–96 729 725, 114 baserEkson 9: 96 730 780–96 730 860, 81 baserEkson 10: 96 736 172–96 736 240, 69 baserEkson 11: 96 737 849–96 737 947, 99 baserEkson 12: 96 740 038–96 740 118, 81 baserEkson 13: 96 740 745–96 740 783, 39 baserEkson 14: 96 741 266–96 741 358, 93 baserEkson 15: 96 741 494–96 741 580, 87 baserEkson 16: 96 742 655–96 742 756, 102 baserEkson 17: 96 746 342–96 746 425, 84 baserEkson 18: 96 747 345–96 747 392, 48 baserEkson 19: 96 748 518–96 748 613, 96 baserEkson 20: 96 750 587–96 750 682, 96 baserEkson 21: 96 754 060–96 754 161, 102 baserEkson 22: 96 754 658–96 754 741, 84 baserEkson 23: 96 757 444–96 757 494, 51 baserEkson 24: 96 757 583–96 757 654, 72 baserEkson 25: 96 762 274–96 762 372, 99 baserEkson 26: 96 765 221–96 765 325, 105 baserEkson 27: 96 766 053–96 766 145, 93 baserEkson 28: 96 767 438–96 767 482, 45 baserEkson 29: 96 767 907–96 767 999, 93 baserEkson 30: 96 770 531–96 770 602, 72 baserEkson 31: 96 771 644–96 771 702, 59 baserEkson 32: 96 772 640–96 774 683, 2 044 baser151015202530325′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.

Eksonene utgjør 4,5 kb av genets 112,3 kb, og 2 376 av disse basene koder for proteinet.

Slik leser en genetisk test CAST

5

posisjoner i CAST der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen

Ingen av dem faller i et område som korte avlesninger sliter med.

En helgenomsekvensering dekker alle 112,3 kb av CAST, inkludert introner, og ikke bare de 4,5 kb med eksoner.

Hvor dette kommer fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
  • ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
  • The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
  • Datautgave 2026.10.16-c6eea6bf.

Siter denne siden

APA

Dante Labs. (u.d.). CAST-genet: calpastatin. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/cast

Vancouver

Dante Labs. CAST-genet: calpastatin [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/cast

Én test. En livstid med svar.

Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker

Få mitt Genome Test