Hoppa till innehållet
Använd dina HSA- eller FSA-medel
Sekvensera ditt genom (öppnas i en ny flik)

Gen

CAST

calpastatin

Sammanfattning

Cytogenetisk position
5q15
Koordinater
Kromosom 5: 96 662 376–96 774 683 (GRCh38)
Exoner
32 exoner på 112,3 kb
Protein
791 aminosyror
Tidigare symboler
MIR583HG
MANE Select-transkript
ENST00000675179.1NM_001750.7
Lokustyp
gene with protein product
  • Mycket hög
  • Säker
  • Låg
  • Mycket låg

Kuraterade rapporter som är relevanta för denna gen

Ingen Genome Test-rapport läser CAST ännu. Testet sekvenserar hela ditt genom, så dina data innehåller den ändå.

Så är CAST uppbyggd

  • Kodande sekvens
  • Otranslaterad region
  • Intron
  • Transkriptionsriktning
  • Kända sjukdomsorsakande ställen
  • Sträckor som korta läsningar har svårt för
Kromosom 5, med en parentes där CAST finns. CAST och 6 gener i närheten på kromosom 5, från 96 218 530 till 97 218 529.Kromosom 55q15p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.396,4 Mb96,6 Mb96,8 Mb97 Mb97,2 MbPCSK1: 96 390 333–96 434 143, bakåt-strängPCSK1CAST: 96 662 376–96 774 683, framåt-strängCASTERAP1: 96 759 649–96 808 177, bakåt-strängERAP1ERAP2: 96 875 979–96 919 703, framåt-strängERAP2LNPEP: 96 934 807–97 037 513, framåt-strängLNPEPLIX1: 97 091 867–97 142 846, bakåt-strängLIX1RIOK2: 97 160 867–97 183 297, bakåt-strängRIOK2Diagram över CAST: 32 exoner på framåt-strängen av kromosom 5Exon 5: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 16: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 25: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 1: 96 662 376–96 662 497, 122 baserExon 2: 96 675 539–96 675 601, 63 baserExon 3: 96 695 836–96 695 907, 72 baserExon 4: 96 722 639–96 722 698, 60 baserExon 5: 96 726 794–96 726 859, 66 baserExon 6: 96 727 489–96 727 530, 42 baserExon 7: 96 729 153–96 729 209, 57 baserExon 8: 96 729 612–96 729 725, 114 baserExon 9: 96 730 780–96 730 860, 81 baserExon 10: 96 736 172–96 736 240, 69 baserExon 11: 96 737 849–96 737 947, 99 baserExon 12: 96 740 038–96 740 118, 81 baserExon 13: 96 740 745–96 740 783, 39 baserExon 14: 96 741 266–96 741 358, 93 baserExon 15: 96 741 494–96 741 580, 87 baserExon 16: 96 742 655–96 742 756, 102 baserExon 17: 96 746 342–96 746 425, 84 baserExon 18: 96 747 345–96 747 392, 48 baserExon 19: 96 748 518–96 748 613, 96 baserExon 20: 96 750 587–96 750 682, 96 baserExon 21: 96 754 060–96 754 161, 102 baserExon 22: 96 754 658–96 754 741, 84 baserExon 23: 96 757 444–96 757 494, 51 baserExon 24: 96 757 583–96 757 654, 72 baserExon 25: 96 762 274–96 762 372, 99 baserExon 26: 96 765 221–96 765 325, 105 baserExon 27: 96 766 053–96 766 145, 93 baserExon 28: 96 767 438–96 767 482, 45 baserExon 29: 96 767 907–96 767 999, 93 baserExon 30: 96 770 531–96 770 602, 72 baserExon 31: 96 771 644–96 771 702, 59 baserExon 32: 96 772 640–96 774 683, 2 044 baser151015202530325′3′

Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.

Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.

Exoner utgör 4,5 kb av genens 112,3 kb, och 2 376 av dessa baser kodar för proteinet.

Så läser ett genomtest CAST

5

positioner i CAST där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen

Inget av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.

En helgenomsanalys täcker alla 112,3 kb av CAST, med introner inräknade, inte bara de 4,5 kb exoner.

Egenskaper kopplade till CAST

Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som CAST kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.

Externa länkar

Varifrån detta kommer

  • HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
  • MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
  • ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
  • Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
  • Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.

Citera den här sidan

APA

Dante Labs. (u.å.). CAST-genen: calpastatin. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/cast

Vancouver

Dante Labs. CAST-genen: calpastatin [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/cast

Ett test. Ett helt liv av svar.

Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor

Beställ mitt Genome Test