Gén
NDUFA8
NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A8
- HGNC 7692↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000119421↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 4702↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 9q33.2
- Koordináták
- 9. kromoszóma: 122 144 058–122 159 779 (GRCh38)
- Exonok
- 4 exon, összesen 15,7 kb
- Fehérje
- 172 aminosav
- Más néven ismert
- PGIV, MGC793
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000373768.4NM_014222.3
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/ndufa8.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a NDUFA8-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentés
Primary Mitochondrial Disease
- Mitochondrial Respiratory Chain Complex Deficiency
A 61 hozzá kapcsolódó gén egyike
Isolated deficiencies of complex I, II, III, IV or V, caused by variants in nuclear or mitochondrial genes, which can affect the brain, muscles, heart, liver and other energy-demanding organs.
- 1 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Knowing can end a diagnostic search and guide surveillance of affected organs and avoidance of drugs toxic to mitochondria.
A NDUFA8 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 15,7 kb-jából 0,8 kb-ot tesznek ki; ezek közül 519 bázis kódolja a fehérjét.
NDUFA8 szekvenálása
4Könnyű
Mennyire nehéz a NDUFA8 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból
0 · Könnyű100 · Nehéz
A NDUFA8 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.
Ami tovább nehezíti: a NDUFA8 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban
- LeképezhetőségOlyan szakaszok, ahol a 100 vagy 250 bp-os olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen, így a hívás ott hiányozhat vagy hibás lehet. Súly: 100%.0%
- HomológiaSzegmentális duplikációk: a genom más helyein lévő másolatok, például paralógok és pszeudogének, legalább 90%-os azonossággal. Súly: 60%.0%
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Súly: 60%.0%
- Referencia-lefedettségA közeli referencia-összeszerelés hiányai, ahol nincs olyan szekvencia, amelyhez az olvasatok igazodhatnának. Súly: 50%.0%
- IsmétlődésekTandem ismétlődések és egyetlen bázisból álló ismétlések, amelyeken az olvasatok megcsúsznak, és amelyeket esetleg nem fognak át. Súly: 30%.0%
- GC-tartalomOlyan szakaszok, ahol a G és C bázisok aránya 25% alatti vagy 65% feletti, és amelyeket a könyvtárkészítés gyengén fed le. Súly: 20%.19%
A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk kiMinden oszlop a NDUFA8 exonbázisainak azon arányát mutatja, amely az adott típusú nehéz régióban van. Bármelyik típus önmagában is nehézzé teheti a gént, a további típusok azonban egyre kevesebbet adnak hozzá: 0, ha egy bázis sem esik egyik típusba sem, 100, ha minden bázis olyan helyen van, ahol az olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen.
1
a NDUFA8 génben olyan pozíció, ahol a ClinVar kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősít egy változást
Ezek közül egy sem esik olyan régióba, amelyet a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
A teljes genomszekvenálás a NDUFA8 mind a 15,7 kb-os hosszát lefedi, beleértve az intronokat is, nem csak az exonok 0,8 kb-át.
ClinVar pathogenic variants (1)
The NDUFA8 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Valószínűleg patogén 1
| Variáns | Conditions | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|
| NM_014222.3(NDUFA8):c.403C>T (p.Arg135Ter) (opens in a new tab) | mitochondrial complex I deficiency, nuclear type 37 | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- ACAD9acyl-CoA dehydrogenase family member 91 betegséget oszt meg
- ATP5F1AATP synthase F1 subunit alpha1 betegséget oszt meg
- ATP5F1DATP synthase F1 subunit delta1 betegséget oszt meg
- ATP5F1EATP synthase F1 subunit epsilon1 betegséget oszt meg
- BCS1LBCS1 ubiquinol-cytochrome c reductase complex chaperone1 betegséget oszt meg
- COA6cytochrome c oxidase assembly factor 61 betegséget oszt meg
- COA8cytochrome c oxidase assembly factor 81 betegséget oszt meg
- COX10cytochrome c oxidase assembly factor heme A:farnesyltransferase COX101 betegséget oszt meg
- COX15cytochrome c oxidase assembly factor COX151 betegséget oszt meg
- COX16cytochrome c oxidase assembly factor COX161 betegséget oszt meg
- COX20cytochrome c oxidase assembly factor COX201 betegséget oszt meg
- COX6B1cytochrome c oxidase subunit 6B11 betegséget oszt meg
A(z) NDUFA8 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) NDUFA8 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-19 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
- A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.19-9814e911.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). NDUFA8 gén: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A8. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/ndufa8
Dante Labs. NDUFA8 gén: NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A8 [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/ndufa8
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt