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Gène

TRIM46

tripartite motif containing 46

Résumé

Localisation cytogénétique
1q22
Coordonnées
Chromosome 1 : 155 173 849–155 184 970 (GRCh38)
Exons
10 exons sur 11,1 kb
Protéine
759 acides aminés
Aussi appelé
FLJ23229, TRIFIC
Transcrit MANE Select
ENST00000334634.9NM_025058.5
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore TRIM46. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de TRIM46

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 1, avec un crochet à l'emplacement de TRIM46. TRIM46 et 35 gènes à proximité sur le chromosome 1, de 154 679 410 à 155 679 409.Chromosome 11q22p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44154,8 Mb155 Mb155,2 Mb155,4 Mb155,6 MbKCNN3 : 154 697 455–154 870 340, brin inverseKCNN3PMVK : 154 924 732–154 937 008, brin inversePMVKPBXIP1 : 154 944 059–154 956 451, brin inversePYGO2 : 154 957 025–154 963 853, brin inverseSHC1 : 154 962 284–154 974 452, brin inverseSHC1CKS1B : 154 974 641–154 979 256, brin directCKS1BFLAD1 : 154 983 311–154 993 111, brin directFLAD1LENEP : 154 993 586–154 994 315, brin directLENEPZBTB7B : 155 002 543–155 018 525, brin directDCST2 : 155 018 520–155 033 781, brin inverseDCST1 : 155 033 824–155 050 930, brin directADAM15 : 155 050 566–155 062 780, brin directADAM15EFNA4 : 155 063 718–155 069 553, brin directEFNA4EFNA4-EFNA3 : 155 063 748–155 086 807, brin directEFNA4-EFNA3EFNA3 : 155 078 823–155 087 538, brin directEFNA3EFNA1 : 155 127 452–155 134 899, brin directEFNA1SLC50A1 : 155 135 344–155 138 857, brin directDPM3 : 155 138 457–155 140 595, brin inverseDPM3KRTCAP2 : 155 169 182–155 173 475, brin inverseKRTCAP2 : 155 169 409–155 187 272, brin inverseTRIM46 : 155 173 849–155 184 970, brin directTRIM46MUC1 : 155 185 824–155 192 916, brin inverseMUC1THBS3 : 155 195 584–155 209 203, brin inverseMTX1 : 155 208 695–155 213 824, brin directGBA1 : 155 231 270–155 245 178, brin inverseGBA1ENTREP3 : 155 247 205–155 255 824, brin inverseENTREP3SCAMP3 : 155 255 979–155 262 433, brin inverseSCAMP3CLK2 : 155 262 747–155 278 491, brin inverseCLK2HCN3 : 155 277 328–155 289 848, brin directHCN3PKLR : 155 289 265–155 301 443, brin inverseFDPS : 155 304 786–155 320 666, brin directFDPSRUSC1 : 155 320 739–155 331 422, brin directRUSC1ASH1L : 155 335 268–155 563 162, brin inverseASH1LMSTO1 : 155 563 235–155 616 644, brin directMSTO1 : 155 626 755–155 648 640, brin inverseYY1AP1 : 155 659 446–155 689 334, brin inverseYY1AP1Schéma de TRIM46 : 10 exons sur le brin direct du chromosome 1Exon 1 : 155 173 849–155 174 029, 181 basesExon 2 : 155 175 386–155 175 647, 262 basesExon 3 : 155 175 888–155 176 231, 344 basesExon 4 : 155 176 932–155 177 075, 144 basesExon 5 : 155 177 195–155 177 290, 96 basesExon 6 : 155 178 002–155 178 255, 254 basesExon 7 : 155 178 492–155 178 613, 122 basesExon 8 : 155 179 632–155 179 934, 303 basesExon 9 : 155 181 852–155 182 149, 298 basesExon 10 : 155 183 797–155 184 970, 1 174 bases123456789105′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 3,2 kb sur les 11,1 kb du gène ; 2 280 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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Dante Labs. (s.d.). Gène TRIM46 : tripartite motif containing 46. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/trim46

Vancouver

Dante Labs. Gène TRIM46 : tripartite motif containing 46 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/trim46

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