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Gène

SIGLEC11

sialic acid binding Ig like lectin 11

Résumé

Localisation cytogénétique
19q13.33
Coordonnées
Chromosome 19 : 49 948 985–49 961 172 (GRCh38)
Exons
11 exons sur 12,2 kb
Protéine
698 acides aminés
Transcrit MANE Select
ENST00000447370.6NM_052884.3
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SIGLEC11. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SIGLEC11

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 19, avec un crochet à l'emplacement de SIGLEC11. SIGLEC11 et 41 gènes à proximité sur le chromosome 19, de 49 455 079 à 50 455 078.Chromosome 1919q13.33p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4349,6 Mb49,8 Mb50 Mb50,2 Mb50,4 MbALDH16A1 : 49 453 146–49 471 052, brin direct : 49 462 752–49 486 231, brin directFLT3LG : 49 474 150–49 486 233, brin directFLT3LGRPL13A : 49 487 510–49 493 057, brin directRPL13ARPS11 : 49 496 233–49 499 903, brin directRPS11FCGRT : 49 506 806–49 526 917, brin directFCGRTRCN3 : 49 526 534–49 579 703, brin directRCN3NOSIP : 49 555 207–49 592 927, brin inverseNOSIPPRRG2 : 49 580 646–49 591 004, brin directPRRG2PRR12 : 49 591 108–49 626 439, brin directPRR12RRAS : 49 634 555–49 640 211, brin inverseRRASSCAF1 : 49 640 488–49 658 649, brin directIRF3 : 49 659 569–49 665 864, brin inverseBCL2L12 : 49 664 622–49 673 917, brin directBCL2L12PRMT1 : 49 675 786–49 689 029, brin directPRMT1ADM5 : 49 688 953–49 690 575, brin directADM5CPT1C : 49 690 898–49 713 733, brin directCPT1CTSKS : 49 739 753–49 763 329, brin inverseTSKSAP2A1 : 49 766 912–49 807 114, brin directAP2A1FUZ : 49 806 866–49 817 376, brin inverseFUZMED25 : 49 818 269–49 840 384, brin directMED25PTOV1 : 49 850 735–49 860 744, brin directPTOV1PNKP : 49 859 882–49 878 351, brin inversePNKPAKT1S1 : 49 869 023–49 879 470, brin inverseAKT1S1TBC1D17 : 49 877 501–49 888 751, brin directIL4I1 : 49 889 654–49 929 926, brin inverseNUP62 : 49 906 825–49 929 926, brin inverse : 49 909 501–49 958 391, brin inverseATF5 : 49 923 910–49 933 935, brin directATF5SIGLEC11 : 49 948 985–49 961 172, brin inverseSIGLEC11SIGLEC16 : 49 969 600–49 975 819, brin directSIGLEC16VRK3 : 49 974 537–50 025 946, brin inverseVRK3ZNF473 : 50 025 714–50 053 414, brin directZNF473IZUMO2 : 50 152 537–50 163 281, brin inverseIZUMO2MYH14 : 50 188 181–50 310 545, brin directMYH14KCNC3 : 50 311 937–50 333 515, brin inverseKCNC3NR1H2 : 50 329 639–50 383 404, brin directNR1H2NAPSA : 50 358 472–50 369 342, brin inverseNAPSAPOLD1 : 50 384 204–50 418 018, brin directPOLD1 : 50 415 799–50 428 409, brin directSPIB : 50 418 931–50 431 314, brin directSPIBMYBPC2 : 50 432 772–50 466 328, brin directMYBPC2Schéma de SIGLEC11 : 11 exons sur le brin inverse du chromosome 19Exon 11 : 49 948 985–49 950 236, 1 252 basesExon 10 : 49 951 891–49 951 972, 82 basesExon 9 : 49 952 298–49 952 394, 97 basesExon 8 : 49 958 283–49 958 570, 288 basesExon 7 : 49 958 643–49 958 900, 258 basesExon 6 : 49 959 030–49 959 077, 48 basesExon 5 : 49 959 360–49 959 623, 264 basesExon 4 : 49 959 773–49 959 820, 48 basesExon 3 : 49 960 137–49 960 421, 285 basesExon 2 : 49 960 552–49 960 935, 384 basesExon 1 : 49 961 006–49 961 172, 167 bases11109876543215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 3,2 kb sur les 12,2 kb du gène ; 2 097 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de SIGLEC11

60Difficile

Difficulté de séquençage de SIGLEC11 avec des lectures courtes, sur 100

Une grande partie de SIGLEC11 se situe dans des zones où les lectures courtes peuvent manquer une variation ou la mal placer.

Facteur aggravant : la part des exons de SIGLEC11 située dans chaque type de région difficile

  • Mappabilité39 %
  • Homologie44 %
  • Partagé avec le chrY0 %
  • Couverture de la référence0 %
  • Répétitions4,5 %
  • Teneur en GC45 %

Un score Dante Labs issu de nos propres recherches, fondé sur les cartes des régions difficiles à séquencer de Genome in a Bottle du NIST.Mode de calcul du score

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène SIGLEC11 : sialic acid binding Ig like lectin 11. Consulté le 19 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/siglec11

Vancouver

Dante Labs. Gène SIGLEC11 : sialic acid binding Ig like lectin 11 [Internet]. [consulté le 19 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/siglec11

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