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Gène

ROGDI

rogdi atypical leucine zipper

Résumé

Localisation cytogénétique
16p13.3
Coordonnées
Chromosome 16 : 4 796 968–4 802 633 (GRCh38)
Exons
11 exons sur 5,7 kb
Protéine
287 acides aminés
Aussi appelé
FLJ22386, ROGD1, RAV2
Transcrit MANE Select
ENST00000322048.12NM_024589.3
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore ROGDI. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de ROGDI

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
Chromosome 16, avec un crochet à l'emplacement de ROGDI. ROGDI et 27 gènes à proximité sur le chromosome 16, de 4 299 801 à 5 299 800.Chromosome 1616p13.3p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.34,4 Mb4,6 Mb4,8 Mb5 Mb5,2 MbGLIS2 : 4 314 761–4 339 597, brin directGLIS2PAM16 : 4 330 378–4 355 607, brin inversePAM16CORO7-PAM16 : 4 340 251–4 420 494, brin inverseCORO7-PAM16CORO7 : 4 354 542–4 425 705, brin inverseCORO7VASN : 4 371 841–4 383 538, brin directVASNDNAJA3 : 4 425 805–4 460 593, brin directDNAJA3NMRAL1 : 4 461 673–4 495 763, brin inverseNMRAL1HMOX2 : 4 474 246–4 510 663, brin directHMOX2CDIP1 : 4 510 619–4 538 833, brin inverseCDIP1C16orf96 : 4 556 336–4 600 772, brin directC16orf96UBALD1 : 4 608 879–4 615 046, brin inverseUBALD1MGRN1 : 4 616 493–4 690 977, brin directMGRN1NUDT16L1 : 4 693 562–4 695 861, brin directNUDT16L1ANKS3 : 4 696 500–4 734 388, brin inverseANKS3DNAAF8 : 4 734 315–4 749 396, brin directDNAAF8ZNF500 : 4 748 239–4 767 624, brin inverseZNF500SEPTIN12 : 4 777 606–4 788 398, brin inverseSEPTIN12SMIM22 : 4 788 376–4 796 731, brin directSMIM22ROGDI : 4 796 968–4 802 633, brin inverseROGDIGLYR1 : 4 803 202–4 847 343, brin inverseGLYR1UBN1 : 4 846 665–4 882 401, brin directUBN1PPL : 4 879 449–4 960 741, brin inversePPLSEC14L5 : 4 958 290–5 019 157, brin directSEC14L5NAGPA : 5 024 756–5 034 141, brin inverseNAGPAALG1 : 5 033 702–5 087 379, brin directALG1C16orf89 : 5 042 772–5 066 167, brin inverseC16orf89EEF2KMT : 5 084 113–5 097 909, brin inverseEEF2KMTRBFOX1 : 5 239 802–7 713 340, brin directRBFOX1Schéma de ROGDI : 11 exons sur le brin inverse du chromosome 16Exon 10 : 1 site connu associé à une maladieExon 9 : 3 sites connus associés à une maladieExon 8 : 2 sites connus associés à une maladieExon 7 : 2 sites connus associés à une maladieExon 6 : 2 sites connus associés à une maladieExon 5 : 5 sites connus associés à une maladieExon 4 : 4 sites connus associés à une maladieExon 3 : 2 sites connus associés à une maladieExon 2 : 4 sites connus associés à une maladieExon 11 : 4 796 968–4 797 501, 534 basesExon 10 : 4 797 714–4 797 840, 127 basesExon 9 : 4 797 938–4 797 987, 50 basesExon 8 : 4 798 071–4 798 184, 114 basesExon 7 : 4 798 569–4 798 667, 99 basesExon 6 : 4 799 686–4 799 781, 96 basesExon 5 : 4 800 498–4 800 578, 81 basesExon 4 : 4 801 267–4 801 321, 55 basesExon 3 : 4 801 503–4 801 585, 83 basesExon 2 : 4 802 382–4 802 453, 72 basesExon 1 : 4 802 527–4 802 633, 107 bases11109876543215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 1,4 kb sur les 5,7 kb du gène ; 864 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit ROGDI

41

positions dans ROGDI où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 5,7 kb de ROGDI, introns compris, et pas seulement les 1,4 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène ROGDI : rogdi atypical leucine zipper. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/rogdi

Vancouver

Dante Labs. Gène ROGDI : rogdi atypical leucine zipper [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/rogdi

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