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Gène

UBALD1

UBA like domain containing 1

Résumé

Localisation cytogénétique
16p13.3
Coordonnées
Chromosome 16 : 4 608 884–4 614 888 (GRCh38)
Exons
3 exons sur 6 kb
Protéine
177 acides aminés
Symboles précédents
FAM100A
Transcrit MANE Select
ENST00000283474.12NM_145253.3
Type de locus
Codant pour une protéine
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore UBALD1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de UBALD1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 16, avec un crochet à l'emplacement de UBALD1. UBALD1 et 29 gènes à proximité sur le chromosome 16, de 4 111 886 à 5 111 885.Chromosome 1616p13.3p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.34,2 Mb4,4 Mb4,6 Mb4,8 Mb5 MbADCY9 : 3 953 387–4 116 493, brin inverseADCY9SRL : 4 189 369–4 242 283, brin inverseSRLTFAP4 : 4 257 186–4 273 075, brin inverseTFAP4GLIS2 : 4 314 761–4 339 597, brin directGLIS2PAM16 : 4 330 378–4 355 607, brin inversePAM16CORO7-PAM16 : 4 340 251–4 420 494, brin inverseCORO7-PAM16CORO7 : 4 354 542–4 425 705, brin inverseCORO7VASN : 4 371 841–4 383 538, brin directVASNDNAJA3 : 4 425 805–4 460 593, brin directDNAJA3NMRAL1 : 4 461 673–4 495 763, brin inverseNMRAL1HMOX2 : 4 474 246–4 510 663, brin directHMOX2CDIP1 : 4 510 619–4 538 833, brin inverseCDIP1C16orf96 : 4 556 336–4 600 772, brin directC16orf96UBALD1 : 4 608 884–4 614 888, brin inverseUBALD1MGRN1 : 4 616 493–4 690 977, brin directMGRN1NUDT16L1 : 4 693 562–4 695 861, brin directNUDT16L1ANKS3 : 4 696 500–4 734 388, brin inverseANKS3DNAAF8 : 4 734 315–4 749 396, brin directDNAAF8ZNF500 : 4 748 239–4 767 624, brin inverseZNF500SEPTIN12 : 4 777 606–4 788 398, brin inverseSEPTIN12SMIM22 : 4 788 376–4 796 731, brin directSMIM22ROGDI : 4 796 962–4 802 926, brin inverseROGDIGLYR1 : 4 803 202–4 847 343, brin inverseGLYR1UBN1 : 4 846 665–4 882 401, brin directUBN1PPL : 4 879 449–4 960 741, brin inversePPLSEC14L5 : 4 958 290–5 019 157, brin directSEC14L5NAGPA : 5 024 756–5 034 141, brin inverseNAGPAALG1 : 5 033 702–5 087 379, brin directALG1C16orf89 : 5 042 772–5 066 167, brin inverseC16orf89EEF2KMT : 5 084 113–5 097 909, brin inverseEEF2KMTSchéma de UBALD1 : 3 exons sur le brin inverse du chromosome 16Exon 3 : 4 608 884–4 609 983, 1 100 basesExon 2 : 4 610 493–4 610 555, 63 basesExon 1 : 4 614 678–4 614 888, 211 bases3215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 1,4 kb sur les 6 kb du gène ; 534 de ces bases codent pour la protéine.

Séquençage de UBALD1

18Modérée

Difficulté de séquençage de UBALD1 avec des lectures courtes, sur 100

Certains exons de UBALD1 se trouvent dans des zones où les lectures courtes peuvent manquer ou mal placer une variation.

Ce qui s'y ajoute : la part des exons de UBALD1 dans chaque type de zone difficile

  • Mappabilité0 %
  • Homologie0 %
  • Shared with chrY0 %
  • Couverture de référence0 %
  • Répétitions14 %
  • Teneur en GC70 %

Un score Dante Labs issu de nos propres recherches, fondé sur les cartes de régions difficiles à séquencer du projet Genome in a Bottle du NIST.Mode de calcul du score

Liens externes

D'où proviennent ces données

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène UBALD1 : UBA like domain containing 1. Consulté le 19 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/ubald1

Vancouver

Dante Labs. Gène UBALD1 : UBA like domain containing 1 [Internet]. [consulté le 19 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/ubald1

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