Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sequence your genome (opens in a new tab)

Geen

ROGDI

rogdi atypical leucine zipper

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
16p13.3
Koordinaadid
Kromosoom 16: 4 796 968–4 802 633 (GRCh38)
Eksonid
11 eksonit, ulatus 5,7 kb
Valk
287 aminohapet
Tuntud ka kui
FLJ22386, ROGD1, RAV2
MANE Select transkript
ENST00000322048.12NM_024589.3
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni ROGDI veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas ROGDI on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
Kromosoom 16, millel on sulg kohal, kus asub ROGDI. ROGDI ja sellele lähedal asuvad 27 geeni kromosoomil 16, vahemikus 4 299 801 kuni 5 299 800.Kromosoom 1616p13.3p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.34,4 Mb4,6 Mb4,8 Mb5 Mb5,2 MbGLIS2: 4 314 761–4 339 597, otsene ahelGLIS2PAM16: 4 330 378–4 355 607, pöördne ahelPAM16CORO7-PAM16: 4 340 251–4 420 494, pöördne ahelCORO7-PAM16CORO7: 4 354 542–4 425 705, pöördne ahelCORO7VASN: 4 371 841–4 383 538, otsene ahelVASNDNAJA3: 4 425 805–4 460 593, otsene ahelDNAJA3NMRAL1: 4 461 673–4 495 763, pöördne ahelNMRAL1HMOX2: 4 474 246–4 510 663, otsene ahelHMOX2CDIP1: 4 510 619–4 538 833, pöördne ahelCDIP1C16orf96: 4 556 336–4 600 772, otsene ahelC16orf96UBALD1: 4 608 879–4 615 046, pöördne ahelUBALD1MGRN1: 4 616 493–4 690 977, otsene ahelMGRN1NUDT16L1: 4 693 562–4 695 861, otsene ahelNUDT16L1ANKS3: 4 696 500–4 734 388, pöördne ahelANKS3DNAAF8: 4 734 315–4 749 396, otsene ahelDNAAF8ZNF500: 4 748 239–4 767 624, pöördne ahelZNF500SEPTIN12: 4 777 606–4 788 398, pöördne ahelSEPTIN12SMIM22: 4 788 376–4 796 731, otsene ahelSMIM22ROGDI: 4 796 968–4 802 633, pöördne ahelROGDIGLYR1: 4 803 202–4 847 343, pöördne ahelGLYR1UBN1: 4 846 665–4 882 401, otsene ahelUBN1PPL: 4 879 449–4 960 741, pöördne ahelPPLSEC14L5: 4 958 290–5 019 157, otsene ahelSEC14L5NAGPA: 5 024 756–5 034 141, pöördne ahelNAGPAALG1: 5 033 702–5 087 379, otsene ahelALG1C16orf89: 5 042 772–5 066 167, pöördne ahelC16orf89EEF2KMT: 5 084 113–5 097 909, pöördne ahelEEF2KMTRBFOX1: 5 239 802–7 713 340, otsene ahelRBFOX1ROGDI skeem: 11 eksonit kromosoomi 16 pöördne ahelalEkson 10: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 9: 3 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 8: 2 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 7: 2 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 6: 2 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 5: 5 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 4: 4 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 3: 2 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 2: 4 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 11: 4 796 968–4 797 501, 534 alustEkson 10: 4 797 714–4 797 840, 127 alustEkson 9: 4 797 938–4 797 987, 50 alustEkson 8: 4 798 071–4 798 184, 114 alustEkson 7: 4 798 569–4 798 667, 99 alustEkson 6: 4 799 686–4 799 781, 96 alustEkson 5: 4 800 498–4 800 578, 81 alustEkson 4: 4 801 267–4 801 321, 55 alustEkson 3: 4 801 503–4 801 585, 83 alustEkson 2: 4 802 382–4 802 453, 72 alustEkson 1: 4 802 527–4 802 633, 107 alust11109876543215′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 1,4 kb kogupikkusega 5,7 kb; neist 864 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse ROGDI

41

kohad geenis ROGDI, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni ROGDI 5,7 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (1,4 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). ROGDI geen: rogdi atypical leucine zipper. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/rogdi

Vancouver

Dante Labs. ROGDI geen: rogdi atypical leucine zipper [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/rogdi

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test