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Gène

NPAS4

neuronal PAS domain protein 4

Résumé

Localisation cytogénétique
11q13.2
Coordonnées
Chromosome 11 : 66 421 035–66 426 707 (GRCh38)
Exons
8 exons sur 5,7 kb
Protéine
802 acides aminés
Aussi appelé
PASD10, NXF, Le-PAS, bHLHe79
Transcrit MANE Select
ENST00000311034.7NM_178864.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore NPAS4. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de NPAS4

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
Chromosome 11, avec un crochet à l'emplacement de NPAS4. NPAS4 et 38 gènes à proximité sur le chromosome 11, de 65 923 871 à 66 923 870.Chromosome 1111q13.2p15.5p15.4p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12p11.2p11.12p11.11q11q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q13.4q13.5q14.1q14.2q14.3q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q2566 Mb66,2 Mb66,4 Mb66,6 Mb66,8 MbTSGA10IP : 65 945 480–65 960 217, brin directSART1 : 65 961 681–65 980 137, brin directEIF1AD : 65 992 009–66 002 472, brin inverseBANF1 : 66 001 832–66 004 170, brin directBANF1CST6 : 66 011 506–66 013 505, brin directCST6CATSPER1 : 66 016 752–66 026 479, brin inverseCATSPER1GAL3ST3 : 66 040 748–66 049 502, brin inverseGAL3ST3SF3B2 : 66 050 729–66 069 308, brin directSF3B2PACS1 : 66 070 017–66 248 638, brin directPACS1KLC2 : 66 257 267–66 267 862, brin directKLC2RAB1B : 66 268 586–66 277 492, brin directRAB1BCNIH2 : 66 278 170–66 285 301, brin directCNIH2YIF1A : 66 284 253–66 289 688, brin inverseYIF1ATMEM151A : 66 291 832–66 299 036, brin directCD248 : 66 314 494–66 317 044, brin inverseRIN1 : 66 330 241–66 336 840, brin inverseRIN1BRMS1 : 66 337 332–66 345 136, brin inverseBRMS1B4GAT1 : 66 345 374–66 347 856, brin inverseB4GAT1SLC29A2 : 66 360 101–66 372 476, brin inverseSLC29A2NPAS4 : 66 421 035–66 426 707, brin directNPAS4MRPL11 : 66 435 075–66 466 738, brin inverseMRPL11PELI3 : 66 466 303–66 478 998, brin directPELI3DPP3 : 66 479 990–66 510 188, brin directDPP3 : 66 509 079–66 533 613, brin directBBS1 : 66 510 606–66 534 660, brin directBBS1ZDHHC24 : 66 520 620–66 546 244, brin inverseZDHHC24ACTN3 : 66 546 395–66 563 334, brin directACTN3CTSF : 66 563 462–66 568 879, brin inverseCTSFCCDC87 : 66 590 176–66 593 063, brin inverseCCDC87CCS : 66 592 843–66 606 703, brin directCCSRBM14 : 66 616 594–66 629 934, brin directRBM14RBM14-RBM4 : 66 616 626–66 646 469, brin directRBM14-RBM4RBM4 : 66 637 771–66 668 380, brin directRBM4RBM4B : 66 664 994–66 677 925, brin inverseRBM4BSPTBN2 : 66 682 496–66 744 670, brin inverseSPTBN2TOP6BL : 66 744 451–66 843 516, brin directTOP6BLRCE1 : 66 842 835–66 848 159, brin directRCE1PC : 66 848 208–66 958 524, brin inversePCLRFN4 : 66 856 546–66 860 475, brin directLRFN4Schéma de NPAS4 : 8 exons sur le brin direct du chromosome 11Exon 1 : 66 421 035–66 421 354, 320 basesExon 2 : 66 422 120–66 422 271, 152 basesExon 3 : 66 422 451–66 422 553, 103 basesExon 4 : 66 422 674–66 422 941, 268 basesExon 5 : 66 423 123–66 423 232, 110 basesExon 6 : 66 423 578–66 423 713, 136 basesExon 7 : 66 423 835–66 425 270, 1 436 basesExon 8 : 66 425 961–66 426 707, 747 bases123456785′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 3,3 kb sur les 5,7 kb du gène ; 2 409 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

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Dante Labs. (s.d.). Gène NPAS4 : neuronal PAS domain protein 4. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/npas4

Vancouver

Dante Labs. Gène NPAS4 : neuronal PAS domain protein 4 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/npas4

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