Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

USP21

ubiquitin specific peptidase 21

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
1q23.3
Koordinaatit
Kromosomi 1: 161 159 500–161 165 723 (GRCh38)
Eksonit
14 eksonia 6,2 kb:n alueella
Proteiini
565 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
USP16
Aiemmat symbolit
USP23
MANE Select -transkripti
ENST00000368002.8NM_001014443.3
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä USP21. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

USP21-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
Kromosomi 1, jossa hakasulke osoittaa USP21-geenin sijainnin. USP21 ja 36 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 1, välillä 160 662 612–161 662 611.Kromosomi 11q23.3p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44160,8 Mb161 Mb161,2 Mb161,4 Mb161,6 MbCD48: 160 678 746–160 711 831, juoste taaksepäinCD48SLAMF7: 160 739 057–160 754 821, juoste eteenpäinSLAMF7LY9: 160 796 071–160 828 601, juoste eteenpäinLY9CD244: 160 829 075–160 862 904, juoste taaksepäinCD244ITLN1: 160 876 539–160 893 012, juoste taaksepäinITLN1ITLN2: 160 944 266–160 954 889, juoste taaksepäinITLN2F11R: 160 985 714–161 023 123, juoste taaksepäin: 160 997 957–161 038 962, juoste taaksepäinTSTD1: 161 037 619–161 039 118, juoste taaksepäinTSTD1USF1: 161 039 249–161 045 982, juoste taaksepäinUSF1ARHGAP30: 161 046 944–161 069 970, juoste taaksepäinARHGAP30NECTIN4: 161 070 988–161 090 045, juoste taaksepäinKLHDC9: 161 098 343–161 100 346, juoste eteenpäinKLHDC9PFDN2: 161 100 556–161 118 070, juoste taaksepäinPFDN2NIT1: 161 118 082–161 125 812, juoste eteenpäinDEDD: 161 120 957–161 133 280, juoste taaksepäinDEDDUFC1: 161 152 776–161 159 368, juoste eteenpäinUFC1USP21: 161 159 500–161 165 723, juoste eteenpäinUSP21PPOX: 161 165 837–161 178 576, juoste eteenpäinPPOXB4GALT3: 161 171 304–161 178 652, juoste taaksepäinB4GALT3ADAMTS4: 161 184 302–161 200 509, juoste taaksepäinNDUFS2: 161 197 104–161 214 723, juoste eteenpäinFCER1G: 161 215 175–161 220 709, juoste eteenpäinAPOA2: 161 222 290–161 227 266, juoste taaksepäinAPOA2TOMM40L: 161 225 939–161 233 755, juoste eteenpäinNR1I3: 161 228 775–161 238 276, juoste taaksepäinPCP4L1: 161 258 136–161 285 450, juoste eteenpäinPCP4L1MPZ: 161 304 735–161 309 974, juoste taaksepäinMPZSDHC: 161 314 352–161 363 774, juoste eteenpäinSDHCCFAP126: 161 364 733–161 367 885, juoste taaksepäinCFAP126FCGR2A: 161 505 415–161 524 013, juoste eteenpäinFCGR2AHSPA6: 161 524 540–161 526 894, juoste eteenpäinHSPA6FCGR3A: 161 541 738–161 550 968, juoste taaksepäinFCGR3A: 161 544 807–161 631 456, juoste taaksepäinFCGR2C: 161 581 339–161 605 662, juoste eteenpäinFCGR2CFCGR3B: 161 623 193–161 631 963, juoste taaksepäinFCGR3BFCGR2B: 161 661 958–161 679 490, juoste eteenpäinFCGR2BUSP21-kaavio: 14 eksonia kromosomin 1 juosteella, eteenpäinEkson 1: 161 159 500–161 159 678, 179 emästäEkson 2: 161 160 366–161 160 506, 141 emästäEkson 3: 161 160 620–161 161 240, 621 emästäEkson 4: 161 162 038–161 162 097, 60 emästäEkson 5: 161 162 270–161 162 390, 121 emästäEkson 6: 161 162 615–161 162 726, 112 emästäEkson 7: 161 162 919–161 163 074, 156 emästäEkson 8: 161 163 555–161 163 619, 65 emästäEkson 9: 161 163 878–161 163 981, 104 emästäEkson 10: 161 164 164–161 164 250, 87 emästäEkson 11: 161 164 534–161 164 612, 79 emästäEkson 12: 161 164 835–161 164 942, 108 emästäEkson 13: 161 165 029–161 165 143, 115 emästäEkson 14: 161 165 357–161 165 723, 367 emästä12345678910111213145′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 2,3 kb geenin 6,2 kb:stä; 1 698 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

Sekvensointi: USP21

1Matala

Kuinka vaikea USP21 on sekvensoida lyhyillä lukemilla, asteikolla 0–100

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Toistot3,4 %
  • GC-pitoisuus7,7 %
  • Referenssin peittävyys0 %

1

kohta USP21-geenissä, jossa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi

Yksikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.

Koko genomin sekvensointi kattaa kaikki 6,2 kb USP21-geenistä, intronit mukaan lukien, eikä vain 2,3 kb eksoneista.

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut sairauksia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joita lyhyet lukemat pitävät vaikeina.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.
  • Tietojulkaisu 2026.10.17-8666dff2.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). USP21-geeni: ubiquitin specific peptidase 21. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/usp21

Vancouver

Dante Labs. USP21-geeni: ubiquitin specific peptidase 21 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/usp21

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test