Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi

Geeni

HCN2

hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium and sodium channel 2

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
19p13.3
Koordinaatit
Kromosomi 19: 589 881–617 159 (GRCh38)
Eksonit
8 eksonia 27,3 kb:n alueella
Proteiini
889 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
BCNG-2, HAC-1
Aiemmat symbolit
BCNG2
MANE Select -transkripti
ENST00000251287.3NM_001194.4
Lokustyyppi
gene with protein product
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

ViitegenomiGRCh38

Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä HCN2. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

HCN2-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 19, jossa hakasulke osoittaa HCN2-geenin sijainnin. HCN2 ja 36 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 19, välillä 103 520–1 103 519.Kromosomi 1919p13.3p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.430,2 Mb0,4 Mb0,6 Mb0,8 Mb1 MbOR4F17: 107 104–117 102, juoste eteenpäinOR4F17PLPP2: 278 504–291 421, juoste taaksepäinPLPP2MIER2: 305 573–344 824, juoste taaksepäinMIER2SPMAP2: 361 747–376 026, juoste taaksepäinSPMAP2C2CD4C: 405 443–409 214, juoste taaksepäinC2CD4CSHC2: 416 315–461 100, juoste taaksepäinSHC2CIMAP1D: 462 728–474 983, juoste taaksepäinCIMAP1DMADCAM1: 489 176–505 343, juoste eteenpäinMADCAM1TPGS1: 507 488–520 846, juoste eteenpäinTPGS1CDC34: 531 435–542 092, juoste eteenpäinCDC34GZMM: 544 034–549 924, juoste eteenpäinGZMMBSG: 571 277–583 498, juoste eteenpäinBSGHCN2: 589 881–617 159, juoste eteenpäinHCN2POLRMT: 617 168–633 619, juoste taaksepäinPOLRMTFGF22: 639 879–644 373, juoste eteenpäinFGF22RNF126: 647 526–663 336, juoste taaksepäinRNF126FSTL3: 676 366–683 793, juoste eteenpäinFSTL3PRSS57: 685 546–695 498, juoste taaksepäinPRSS57PALM: 708 906–748 329, juoste eteenpäinPALMMISP: 748 404–764 363, juoste eteenpäinMISPPTBP1: 797 075–812 327, juoste eteenpäinPTBP1PLPPR3: 810 908–822 619, juoste taaksepäinPLPPR3AZU1: 825 097–832 018, juoste eteenpäinAZU1PRTN3: 840 999–848 255, juoste eteenpäinPRTN3ELANE: 850 951–856 247, juoste eteenpäinCFD: 859 426–869 492, juoste eteenpäinMED16: 867 630–893 222, juoste taaksepäinMED16R3HDM4: 896 503–913 245, juoste taaksepäinR3HDM4KISS1R: 917 287–921 005, juoste eteenpäinKISS1RARID3A: 924 528–975 939, juoste eteenpäinARID3AWDR18: 984 248–998 438, juoste eteenpäinWDR18GRIN3B: 1 000 419–1 009 732, juoste eteenpäinGRIN3BTMEM259: 1 009 615–1 021 270, juoste taaksepäinTMEM259CNN2: 1 026 270–1 039 077, juoste eteenpäinCNN2ABCA7: 1 039 997–1 065 572, juoste eteenpäinABCA7ARHGAP45: 1 065 923–1 087 829, juoste eteenpäinARHGAP45POLR2E: 1 085 104–1 095 486, juoste taaksepäinPOLR2EHCN2-kaavio: 8 eksonia kromosomin 19 juosteella, eteenpäinEksoni 2: 1 tunnettu tautia aiheuttava kohtaEksoni 3: 1 tunnettu tautia aiheuttava kohtaEkson 1: 589 881–590 577, 697 emästäEkson 2: 603 544–603 967, 424 emästäEkson 3: 605 061–605 222, 162 emästäEkson 4: 607 964–608 182, 219 emästäEkson 5: 610 259–610 405, 147 emästäEkson 6: 613 248–613 488, 241 emästäEkson 7: 613 852–614 016, 165 emästäEkson 8: 615 795–617 159, 1 365 emästä123456785′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 3,4 kb geenin 27,3 kb:stä; 2 670 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

Miten genomitesti lukee geeniä HCN2

2

HCN2-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi

Niistä 1 (50 %) osuu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.

  • Low mappability (1 kohta)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.

Kokogenomi kattaa kaikki 27,3 kb geenistä HCN2, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 3,4 kb eksoneja.

Mistä tieto on peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
  • Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
  • Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). HCN2-geeni: hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium and sodium channel 2. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/hcn2

Vancouver

Dante Labs. HCN2-geeni: hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium and sodium channel 2 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/hcn2

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test