Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

TRIM54

tripartite motif containing 54

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
2p23.3
Koordinaadid
Kromosoom 2: 27 282 429–27 307 435 (GRCh38)
Eksonid
9 eksonit, ulatus 25 kb
Valk
358 aminohapet
Tuntud ka kui
MURF, MURF-3
Varasemad tähised
RNF30
MANE Select transkript
ENST00000380075.7NM_187841.3
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni TRIM54 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas TRIM54 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 2, millel on sulg kohal, kus asub TRIM54. TRIM54 ja sellele lähedal asuvad 39 geeni kromosoomil 2, vahemikus 26 794 932 kuni 27 794 931.Kromosoom 22p23.3p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23.3p23.2p23.1p22.3p22.2p22.1p21p16.3p16.2p16.1p15p14p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13q14.1q14.2q14.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q34q35q36.1q36.2q36.3q37.1q37.2q37.326,8 Mb27 Mb27,2 Mb27,4 Mb27,6 MbCENPA: 26 764 289–26 801 067, otsene ahelCENPADPYSL5: 26 847 747–26 950 351, otsene ahelDPYSL5MAPRE3: 26 970 400–27 027 219, otsene ahelMAPRE3TMEM214: 27 032 910–27 041 697, otsene ahelTMEM214AGBL5: 27 042 364–27 070 622, otsene ahelAGBL5OST4: 27 058 735–27 073 830, pöördne ahelOST4EMILIN1: 27 078 044–27 086 408, otsene ahelKHK: 27 086 723–27 100 777, otsene ahelKHKCGREF1: 27 098 853–27 119 139, pöördne ahelABHD1: 27 123 789–27 130 812, otsene ahelABHD1PREB: 27 129 153–27 134 689, pöördne ahelPREBPRR30: 27 136 848–27 139 410, pöördne ahelPRR30TCF23: 27 148 999–27 156 974, otsene ahelTCF23SLC5A6: 27 199 587–27 212 958, pöördne ahelSLC5A6ATRAID: 27 212 012–27 217 178, otsene ahelATRAIDCAD: 27 217 345–27 245 683, otsene ahelCADSLC30A3: 27 253 509–27 275 817, pöördne ahelDNAJC5G: 27 275 430–27 281 499, otsene ahelDNAJC5GTRIM54: 27 282 429–27 307 435, otsene ahelTRIM54UCN: 27 307 400–27 308 445, pöördne ahelUCNMPV17: 27 309 486–27 325 680, pöördne ahelMPV17GTF3C2: 27 324 198–27 357 566, pöördne ahelEIF2B4: 27 363 420–27 370 466, pöördne ahelEIF2B4SNX17: 27 370 496–27 377 535, otsene ahelSNX17ZNF513: 27 377 235–27 380 790, pöördne ahelZNF513PPM1G: 27 381 194–27 409 674, pöördne ahelPPM1GNRBP1: 27 427 790–27 442 260, otsene ahelNRBP1KRTCAP3: 27 442 337–27 446 486, otsene ahelKRTCAP3IFT172: 27 444 374–27 489 839, pöördne ahelIFT172FNDC4: 27 491 260–27 495 631, pöördne ahelFNDC4GCKR: 27 496 055–27 523 688, otsene ahelGCKRSPATA31H1: 27 537 386–27 582 722, otsene ahelSPATA31H1ZNF512: 27 582 969–27 623 217, otsene ahelZNF512CCDC121: 27 625 535–27 629 018, pöördne ahelCCDC121GPN1: 27 628 247–27 652 152, otsene ahelGPN1SUPT7L: 27 642 568–27 663 847, pöördne ahelSUPT7LSLC4A1AP: 27 663 426–27 695 756, otsene ahelSLC4A1APMRPL33: 27 771 683–27 781 484, otsene ahelMRPL33: 27 771 739–27 988 087, otsene ahelRBKS: 27 780 857–27 890 681, pöördne ahelRBKSTRIM54 skeem: 9 eksonit kromosoomi 2 otsene ahelalEkson 1: 27 282 429–27 282 899, 471 alustEkson 2: 27 298 567–27 298 739, 173 alustEkson 3: 27 299 245–27 299 416, 172 alustEkson 4: 27 304 959–27 305 054, 96 alustEkson 5: 27 305 584–27 305 817, 234 alustEkson 6: 27 306 080–27 306 102, 23 alustEkson 7: 27 306 213–27 306 337, 125 alustEkson 8: 27 306 456–27 306 542, 87 alustEkson 9: 27 306 887–27 307 435, 549 alust1246895′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 1,9 kb kogupikkusega 25 kb; neist 1077 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse TRIM54

1

koht geenis TRIM54, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni TRIM54 25 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (1,9 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). TRIM54 geen: tripartite motif containing 54. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/trim54

Vancouver

Dante Labs. TRIM54 geen: tripartite motif containing 54 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/trim54

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test