Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

SMG5

SMG5 nonsense mediated mRNA decay factor

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
1q22
Koordinaadid
Kromosoom 1: 156 249 224–156 282 825 (GRCh38)
Eksonid
22 eksonit, ulatus 33,6 kb
Valk
1016 aminohapet
Tuntud ka kui
KIAA1089, LPTS-RP1, LPTSRP1, RP11-54H19.7, SMG-5, EST1B
MANE Select transkript
ENST00000361813.5NM_015327.3
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni SMG5 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas SMG5 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 1, millel on sulg kohal, kus asub SMG5. SMG5 ja sellele lähedal asuvad 38 geeni kromosoomil 1, vahemikus 155 766 025 kuni 156 766 024.Kromosoom 11q22p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44155,8 Mb156 Mb156,2 Mb156,4 Mb156,6 MbGON4L: 155 749 659–155 859 439, pöördne ahelGON4LSYT11: 155 859 449–155 885 199, otsene ahelSYT11RIT1: 155 897 808–155 911 408, pöördne ahelRIT1KHDC4: 155 913 043–155 934 416, pöördne ahelKHDC4RXFP4: 155 941 638–155 943 087, otsene ahelRXFP4ARHGEF2: 155 944 685–156 007 070, pöördne ahelARHGEF2SSR2: 156 009 041–156 020 972, pöördne ahelSSR2UBQLN4: 156 026 961–156 053 814, pöördne ahelUBQLN4LAMTOR2: 156 053 916–156 058 817, otsene ahelLAMTOR2RAB25: 156 061 147–156 070 514, otsene ahelRAB25MEX3A: 156 072 013–156 082 465, pöördne ahelMEX3ALMNA: 156 082 572–156 140 085, otsene ahelLMNASEMA4A: 156 147 366–156 178 869, otsene ahelSEMA4ASLC25A44: 156 193 932–156 212 796, otsene ahelPMF1-BGLAP: 156 212 982–156 243 332, otsene ahelPMF1: 156 212 989–156 240 585, otsene ahelPMF1BGLAP: 156 242 154–156 243 317, otsene ahelBGLAPPAQR6: 156 243 318–156 248 647, pöördne ahelPAQR6SMG5: 156 249 224–156 282 825, pöördne ahelSMG5TMEM79: 156 282 928–156 293 185, otsene ahelTMEM79GLMP: 156 290 088–156 295 699, pöördne ahelGLMPVHLL: 156 298 624–156 299 307, pöördne ahelVHLLCCT3: 156 308 792–156 367 873, pöördne ahelCCT3TSACC: 156 337 314–156 347 019, otsene ahelTSACCRHBG: 156 369 015–156 385 221, otsene ahelRHBGMEF2D: 156 463 727–156 501 266, pöördne ahelMEF2DIQGAP3: 156 525 405–156 572 604, pöördne ahelIQGAP3TTC24: 156 579 723–156 587 719, otsene ahelTTC24NAXE: 156 591 738–156 609 507, otsene ahelNAXEGPATCH4: 156 594 301–156 601 496, pöördne ahelGPATCH4HAPLN2: 156 619 331–156 626 590, otsene ahelHAPLN2BCAN: 156 641 390–156 659 532, otsene ahelBCANNES: 156 668 763–156 677 415, pöördne ahelNESCRABP2: 156 699 592–156 708 094, pöördne ahelCRABP2ISG20L2: 156 720 651–156 728 836, pöördne ahelISG20L2METTL25B: 156 728 442–156 736 960, otsene ahelMETTL25BMRPL24: 156 737 292–156 741 590, pöördne ahelMRPL24HDGF: 156 742 109–156 766 925, pöördne ahelPRCC: 156 750 610–156 800 818, otsene ahelSMG5 skeem: 22 eksonit kromosoomi 1 pöördne ahelalEkson 22: 156 249 224–156 250 670, 1447 alustEkson 21: 156 250 858–156 250 996, 139 alustEkson 20: 156 251 403–156 251 477, 75 alustEkson 19: 156 252 414–156 252 504, 91 alustEkson 18: 156 252 919–156 253 078, 160 alustEkson 17: 156 253 449–156 253 508, 60 alustEkson 16: 156 259 005–156 259 163, 159 alustEkson 15: 156 260 451–156 260 626, 176 alustEkson 14: 156 261 333–156 261 408, 76 alustEkson 13: 156 263 395–156 263 570, 176 alustEkson 12: 156 265 781–156 266 380, 600 alustEkson 11: 156 266 541–156 266 678, 138 alustEkson 10: 156 267 470–156 267 678, 209 alustEkson 9: 156 268 115–156 268 183, 69 alustEkson 8: 156 268 290–156 268 415, 126 alustEkson 7: 156 272 320–156 272 398, 79 alustEkson 6: 156 273 361–156 273 450, 90 alustEkson 5: 156 274 597–156 274 686, 90 alustEkson 4: 156 277 085–156 277 241, 157 alustEkson 3: 156 277 925–156 278 048, 124 alustEkson 2: 156 278 936–156 279 034, 99 alustEkson 1: 156 282 607–156 282 825, 219 alust22201816141210864215′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 4,6 kb kogupikkusega 33,6 kb; neist 3051 alust kodeerivad valku.

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). SMG5 geen: SMG5 nonsense mediated mRNA decay factor. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/smg5

Vancouver

Dante Labs. SMG5 geen: SMG5 nonsense mediated mRNA decay factor [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/smg5

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test