Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi

Geeni

SMG5

SMG5 nonsense mediated mRNA decay factor

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
1q22
Koordinaatit
Kromosomi 1: 156 249 224–156 282 825 (GRCh38)
Eksonit
22 eksonia 33,6 kb:n alueella
Proteiini
1 016 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
KIAA1089, LPTS-RP1, LPTSRP1, RP11-54H19.7, SMG-5, EST1B
MANE Select -transkripti
ENST00000361813.5NM_015327.3
Lokustyyppi
gene with protein product
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

ViitegenomiGRCh38

Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä SMG5. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

SMG5-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 1, jossa hakasulke osoittaa SMG5-geenin sijainnin. SMG5 ja 38 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 1, välillä 155 766 025–156 766 024.Kromosomi 11q22p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44155,8 Mb156 Mb156,2 Mb156,4 Mb156,6 MbGON4L: 155 749 659–155 859 439, juoste taaksepäinGON4LSYT11: 155 859 449–155 885 199, juoste eteenpäinSYT11RIT1: 155 897 808–155 911 408, juoste taaksepäinRIT1KHDC4: 155 913 043–155 934 416, juoste taaksepäinKHDC4RXFP4: 155 941 638–155 943 087, juoste eteenpäinRXFP4ARHGEF2: 155 944 685–156 007 070, juoste taaksepäinARHGEF2SSR2: 156 009 041–156 020 972, juoste taaksepäinSSR2UBQLN4: 156 026 961–156 053 814, juoste taaksepäinUBQLN4LAMTOR2: 156 053 916–156 058 817, juoste eteenpäinLAMTOR2RAB25: 156 061 147–156 070 514, juoste eteenpäinRAB25MEX3A: 156 072 013–156 082 465, juoste taaksepäinMEX3ALMNA: 156 082 572–156 140 085, juoste eteenpäinLMNASEMA4A: 156 147 366–156 178 869, juoste eteenpäinSEMA4ASLC25A44: 156 193 932–156 212 796, juoste eteenpäinPMF1-BGLAP: 156 212 982–156 243 332, juoste eteenpäinPMF1: 156 212 989–156 240 585, juoste eteenpäinPMF1BGLAP: 156 242 154–156 243 317, juoste eteenpäinBGLAPPAQR6: 156 243 318–156 248 647, juoste taaksepäinPAQR6SMG5: 156 249 224–156 282 825, juoste taaksepäinSMG5TMEM79: 156 282 928–156 293 185, juoste eteenpäinTMEM79GLMP: 156 290 088–156 295 699, juoste taaksepäinGLMPVHLL: 156 298 624–156 299 307, juoste taaksepäinVHLLCCT3: 156 308 792–156 367 873, juoste taaksepäinCCT3TSACC: 156 337 314–156 347 019, juoste eteenpäinTSACCRHBG: 156 369 015–156 385 221, juoste eteenpäinRHBGMEF2D: 156 463 727–156 501 266, juoste taaksepäinMEF2DIQGAP3: 156 525 405–156 572 604, juoste taaksepäinIQGAP3TTC24: 156 579 723–156 587 719, juoste eteenpäinTTC24NAXE: 156 591 738–156 609 507, juoste eteenpäinNAXEGPATCH4: 156 594 301–156 601 496, juoste taaksepäinGPATCH4HAPLN2: 156 619 331–156 626 590, juoste eteenpäinHAPLN2BCAN: 156 641 390–156 659 532, juoste eteenpäinBCANNES: 156 668 763–156 677 415, juoste taaksepäinNESCRABP2: 156 699 592–156 708 094, juoste taaksepäinCRABP2ISG20L2: 156 720 651–156 728 836, juoste taaksepäinISG20L2METTL25B: 156 728 442–156 736 960, juoste eteenpäinMETTL25BMRPL24: 156 737 292–156 741 590, juoste taaksepäinMRPL24HDGF: 156 742 109–156 766 925, juoste taaksepäinPRCC: 156 750 610–156 800 818, juoste eteenpäinSMG5-kaavio: 22 eksonia kromosomin 1 juosteella, taaksepäinEkson 22: 156 249 224–156 250 670, 1 447 emästäEkson 21: 156 250 858–156 250 996, 139 emästäEkson 20: 156 251 403–156 251 477, 75 emästäEkson 19: 156 252 414–156 252 504, 91 emästäEkson 18: 156 252 919–156 253 078, 160 emästäEkson 17: 156 253 449–156 253 508, 60 emästäEkson 16: 156 259 005–156 259 163, 159 emästäEkson 15: 156 260 451–156 260 626, 176 emästäEkson 14: 156 261 333–156 261 408, 76 emästäEkson 13: 156 263 395–156 263 570, 176 emästäEkson 12: 156 265 781–156 266 380, 600 emästäEkson 11: 156 266 541–156 266 678, 138 emästäEkson 10: 156 267 470–156 267 678, 209 emästäEkson 9: 156 268 115–156 268 183, 69 emästäEkson 8: 156 268 290–156 268 415, 126 emästäEkson 7: 156 272 320–156 272 398, 79 emästäEkson 6: 156 273 361–156 273 450, 90 emästäEkson 5: 156 274 597–156 274 686, 90 emästäEkson 4: 156 277 085–156 277 241, 157 emästäEkson 3: 156 277 925–156 278 048, 124 emästäEkson 2: 156 278 936–156 279 034, 99 emästäEkson 1: 156 282 607–156 282 825, 219 emästä22201816141210864215′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 4,6 kb geenin 33,6 kb:stä; 3 051 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

Mistä tieto on peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). SMG5-geeni: SMG5 nonsense mediated mRNA decay factor. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/smg5

Vancouver

Dante Labs. SMG5-geeni: SMG5 nonsense mediated mRNA decay factor [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/smg5

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test