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Gen

SMG5

SMG5 nonsense mediated mRNA decay factor

Zusammenfassung

Zytogenetische Lage
1q22
Koordinaten
Chromosom 1: 156.249.224–156.282.825 (GRCh38)
Exons
22 Exons über 33,6 kb
Protein
1.016 Aminosäuren
Auch bekannt als
KIAA1089, LPTS-RP1, LPTSRP1, RP11-54H19.7, SMG-5, EST1B
MANE-Select-Transkript
ENST00000361813.5NM_015327.3
Locus-Typ
gene with protein product
  • Sehr hoch
  • Zuversichtlich
  • Niedrig
  • Sehr niedrig

ReferenzgenomGRCh38

Die Positionen auf den Gen- und Variantenseiten richten sich nach dieser Auswahl, in diesem Browser.

Kuratierte Berichte zu diesem Gen

Kein Genome Test-Bericht wertet SMG5 bisher aus. Der Test sequenziert Ihr gesamtes Genom, daher sind die Daten trotzdem enthalten.

Aufbau von SMG5

  • Kodierende Sequenz
  • Nicht translatierte Region
  • Intron
  • Transkriptionsrichtung
  • Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen
Chromosom 1, mit einer Klammer, an der SMG5 liegt. SMG5 und 38 Gene in der Nähe auf Chromosom 1, von 155.766.025 bis 156.766.024.Chromosom 11q22p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44155,8 Mb156 Mb156,2 Mb156,4 Mb156,6 MbGON4L: 155.749.659–155.859.439, Minus-StrangGON4LSYT11: 155.859.449–155.885.199, Plus-StrangSYT11RIT1: 155.897.808–155.911.408, Minus-StrangRIT1KHDC4: 155.913.043–155.934.416, Minus-StrangKHDC4RXFP4: 155.941.638–155.943.087, Plus-StrangRXFP4ARHGEF2: 155.944.685–156.007.070, Minus-StrangARHGEF2SSR2: 156.009.041–156.020.972, Minus-StrangSSR2UBQLN4: 156.026.961–156.053.814, Minus-StrangUBQLN4LAMTOR2: 156.053.916–156.058.817, Plus-StrangLAMTOR2RAB25: 156.061.147–156.070.514, Plus-StrangRAB25MEX3A: 156.072.013–156.082.465, Minus-StrangMEX3ALMNA: 156.082.572–156.140.085, Plus-StrangLMNASEMA4A: 156.147.366–156.178.869, Plus-StrangSEMA4ASLC25A44: 156.193.932–156.212.796, Plus-StrangPMF1-BGLAP: 156.212.982–156.243.332, Plus-StrangPMF1: 156.212.989–156.240.585, Plus-StrangPMF1BGLAP: 156.242.154–156.243.317, Plus-StrangBGLAPPAQR6: 156.243.318–156.248.647, Minus-StrangPAQR6SMG5: 156.249.224–156.282.825, Minus-StrangSMG5TMEM79: 156.282.928–156.293.185, Plus-StrangTMEM79GLMP: 156.290.088–156.295.699, Minus-StrangGLMPVHLL: 156.298.624–156.299.307, Minus-StrangVHLLCCT3: 156.308.792–156.367.873, Minus-StrangCCT3TSACC: 156.337.314–156.347.019, Plus-StrangTSACCRHBG: 156.369.015–156.385.221, Plus-StrangRHBGMEF2D: 156.463.727–156.501.266, Minus-StrangMEF2DIQGAP3: 156.525.405–156.572.604, Minus-StrangIQGAP3TTC24: 156.579.723–156.587.719, Plus-StrangTTC24NAXE: 156.591.738–156.609.507, Plus-StrangNAXEGPATCH4: 156.594.301–156.601.496, Minus-StrangGPATCH4HAPLN2: 156.619.331–156.626.590, Plus-StrangHAPLN2BCAN: 156.641.390–156.659.532, Plus-StrangBCANNES: 156.668.763–156.677.415, Minus-StrangNESCRABP2: 156.699.592–156.708.094, Minus-StrangCRABP2ISG20L2: 156.720.651–156.728.836, Minus-StrangISG20L2METTL25B: 156.728.442–156.736.960, Plus-StrangMETTL25BMRPL24: 156.737.292–156.741.590, Minus-StrangMRPL24HDGF: 156.742.109–156.766.925, Minus-StrangPRCC: 156.750.610–156.800.818, Plus-StrangDiagramm von SMG5: 22 Exons auf dem Minus-Strang von Chromosom 1Exon 22: 156.249.224–156.250.670, 1.447 BasenExon 21: 156.250.858–156.250.996, 139 BasenExon 20: 156.251.403–156.251.477, 75 BasenExon 19: 156.252.414–156.252.504, 91 BasenExon 18: 156.252.919–156.253.078, 160 BasenExon 17: 156.253.449–156.253.508, 60 BasenExon 16: 156.259.005–156.259.163, 159 BasenExon 15: 156.260.451–156.260.626, 176 BasenExon 14: 156.261.333–156.261.408, 76 BasenExon 13: 156.263.395–156.263.570, 176 BasenExon 12: 156.265.781–156.266.380, 600 BasenExon 11: 156.266.541–156.266.678, 138 BasenExon 10: 156.267.470–156.267.678, 209 BasenExon 9: 156.268.115–156.268.183, 69 BasenExon 8: 156.268.290–156.268.415, 126 BasenExon 7: 156.272.320–156.272.398, 79 BasenExon 6: 156.273.361–156.273.450, 90 BasenExon 5: 156.274.597–156.274.686, 90 BasenExon 4: 156.277.085–156.277.241, 157 BasenExon 3: 156.277.925–156.278.048, 124 BasenExon 2: 156.278.936–156.279.034, 99 BasenExon 1: 156.282.607–156.282.825, 219 Basen22201816141210864215′3′

Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.

Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).

Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.

Exons machen 4,6 kb der 33,6 kb des Gens aus; 3.051 dieser Basen kodieren für das Protein.

Woher diese Angaben stammen

  • HGNC: das Symbol des Gens, sein Name, weitere Symbole und seine Lage.
  • MANE Select v1.5, von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.

Diese Seite zitieren

APA

Dante Labs. (o. J.). SMG5-Gen: SMG5 nonsense mediated mRNA decay factor. Abgerufen am 17. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/smg5

Vancouver

Dante Labs. SMG5-Gen: SMG5 nonsense mediated mRNA decay factor [Internet]. [zitiert am 17. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/smg5

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