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Gen

SMG5

SMG5 nonsense mediated mRNA decay factor

Resumen

Localización citogenética
1q22
Coordenadas
Cromosoma 1: 156.249.224–156.282.825 (GRCh38)
Exones
22 exones en 33,6 kb
Proteína
1016 aminoácidos
También conocido como
KIAA1089, LPTS-RP1, LPTSRP1, RP11-54H19.7, SMG-5, EST1B
Transcrito MANE Select
ENST00000361813.5NM_015327.3
Tipo de locus
gene with protein product
  • Muy alta
  • Alta
  • Baja
  • Muy baja

Informes revisados relevantes para este gen

Ningún informe de Genome Test lee aún SMG5. La prueba secuencia todo su genoma, así que sus datos lo incluyen igualmente.

Estructura de SMG5

  • Secuencia codificante
  • Región no traducida
  • Intrón
  • Sentido de la transcripción
  • Regiones que las lecturas cortas tienen dificultad para leer
Cromosoma 1, con un corchete donde se ubica SMG5. SMG5 y 38 genes cercanos en el cromosoma 1, desde 155.766.025 hasta 156.766.024.Cromosoma 11q22p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44155,8 Mb156 Mb156,2 Mb156,4 Mb156,6 MbGON4L: 155.749.659–155.859.439, hebra inversaGON4LSYT11: 155.859.449–155.885.199, hebra directaSYT11RIT1: 155.897.808–155.911.408, hebra inversaRIT1KHDC4: 155.913.043–155.934.416, hebra inversaKHDC4RXFP4: 155.941.638–155.943.087, hebra directaRXFP4ARHGEF2: 155.944.685–156.007.070, hebra inversaARHGEF2SSR2: 156.009.041–156.020.972, hebra inversaSSR2UBQLN4: 156.026.961–156.053.814, hebra inversaUBQLN4LAMTOR2: 156.053.916–156.058.817, hebra directaLAMTOR2RAB25: 156.061.147–156.070.514, hebra directaRAB25MEX3A: 156.072.013–156.082.465, hebra inversaMEX3ALMNA: 156.082.572–156.140.085, hebra directaLMNASEMA4A: 156.147.366–156.178.869, hebra directaSEMA4ASLC25A44: 156.193.932–156.212.796, hebra directaPMF1-BGLAP: 156.212.982–156.243.332, hebra directaPMF1: 156.212.989–156.240.585, hebra directaPMF1BGLAP: 156.242.154–156.243.317, hebra directaBGLAPPAQR6: 156.243.318–156.248.647, hebra inversaPAQR6SMG5: 156.249.224–156.282.825, hebra inversaSMG5TMEM79: 156.282.928–156.293.185, hebra directaTMEM79GLMP: 156.290.088–156.295.699, hebra inversaGLMPVHLL: 156.298.624–156.299.307, hebra inversaVHLLCCT3: 156.308.792–156.367.873, hebra inversaCCT3TSACC: 156.337.314–156.347.019, hebra directaTSACCRHBG: 156.369.015–156.385.221, hebra directaRHBGMEF2D: 156.463.727–156.501.266, hebra inversaMEF2DIQGAP3: 156.525.405–156.572.604, hebra inversaIQGAP3TTC24: 156.579.723–156.587.719, hebra directaTTC24NAXE: 156.591.738–156.609.507, hebra directaNAXEGPATCH4: 156.594.301–156.601.496, hebra inversaGPATCH4HAPLN2: 156.619.331–156.626.590, hebra directaHAPLN2BCAN: 156.641.390–156.659.532, hebra directaBCANNES: 156.668.763–156.677.415, hebra inversaNESCRABP2: 156.699.592–156.708.094, hebra inversaCRABP2ISG20L2: 156.720.651–156.728.836, hebra inversaISG20L2METTL25B: 156.728.442–156.736.960, hebra directaMETTL25BMRPL24: 156.737.292–156.741.590, hebra inversaMRPL24HDGF: 156.742.109–156.766.925, hebra inversaPRCC: 156.750.610–156.800.818, hebra directaDiagrama de SMG5: 22 exones en la hebra inversa del cromosoma 1Exón 22: 156.249.224–156.250.670, 1447 basesExón 21: 156.250.858–156.250.996, 139 basesExón 20: 156.251.403–156.251.477, 75 basesExón 19: 156.252.414–156.252.504, 91 basesExón 18: 156.252.919–156.253.078, 160 basesExón 17: 156.253.449–156.253.508, 60 basesExón 16: 156.259.005–156.259.163, 159 basesExón 15: 156.260.451–156.260.626, 176 basesExón 14: 156.261.333–156.261.408, 76 basesExón 13: 156.263.395–156.263.570, 176 basesExón 12: 156.265.781–156.266.380, 600 basesExón 11: 156.266.541–156.266.678, 138 basesExón 10: 156.267.470–156.267.678, 209 basesExón 9: 156.268.115–156.268.183, 69 basesExón 8: 156.268.290–156.268.415, 126 basesExón 7: 156.272.320–156.272.398, 79 basesExón 6: 156.273.361–156.273.450, 90 basesExón 5: 156.274.597–156.274.686, 90 basesExón 4: 156.277.085–156.277.241, 157 basesExón 3: 156.277.925–156.278.048, 124 basesExón 2: 156.278.936–156.279.034, 99 basesExón 1: 156.282.607–156.282.825, 219 bases22201816141210864215′3′

Exones del transcrito MANE Select del gen (versión v1.5), de NCBI y EMBL-EBI, sobre el genoma de referencia GRCh38.

Bandas cromosómicas del ideograma GRCh38 de UCSC (2022-10-29).

Genes cercanos de Ensembl, versión 116, en GRCh38.

Los exones suman 4,6 kb de los 33,6 kb del gen; 3051 de esas bases codifican la proteína.

Enlaces externos

Origen de estos datos

  • HGNC: el símbolo del gen, su nombre, otros símbolos y su ubicación.
  • MANE Select v1.5, de NCBI y EMBL-EBI: el transcrito, sus exones y la secuencia codificante.

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APA

Dante Labs. (s. f.). Gen SMG5: SMG5 nonsense mediated mRNA decay factor. Consultado el 17 de octubre de 2026, en https://dantelabs.com/es/genes/smg5

Vancouver

Dante Labs. Gen SMG5: SMG5 nonsense mediated mRNA decay factor [Internet]. [citado 17 de octubre de 2026]. Disponible en: https://dantelabs.com/es/genes/smg5

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