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Gene

SMG5

SMG5 nonsense mediated mRNA decay factor

Sintesi

Localizzazione citogenetica
1q22
Coordinate
Cromosoma 1: 156.249.224–156.282.825 (GRCh38)
Esoni
22 esoni su 33,6 kb
Proteina
1016 amminoacidi
Noto anche come
KIAA1089, LPTS-RP1, LPTSRP1, RP11-54H19.7, SMG-5, EST1B
Trascritto MANE Select
ENST00000361813.5NM_015327.3
Tipo di locus
gene with protein product

Genoma di riferimentoGRCh38

Le posizioni nelle pagine di geni e varianti seguono questa scelta, in questo browser.

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora SMG5. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di SMG5

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 1, con una parentesi dove si trova SMG5. SMG5 e 38 geni nelle vicinanze sul cromosoma 1, da 155.766.025 a 156.766.024.Cromosoma 11q22p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44155,8 Mb156 Mb156,2 Mb156,4 Mb156,6 MbGON4L: 155.749.659–155.859.439, filamento inversoGON4LSYT11: 155.859.449–155.885.199, filamento direttoSYT11RIT1: 155.897.808–155.911.408, filamento inversoRIT1KHDC4: 155.913.043–155.934.416, filamento inversoKHDC4RXFP4: 155.941.638–155.943.087, filamento direttoRXFP4ARHGEF2: 155.944.685–156.007.070, filamento inversoARHGEF2SSR2: 156.009.041–156.020.972, filamento inversoSSR2UBQLN4: 156.026.961–156.053.814, filamento inversoUBQLN4LAMTOR2: 156.053.916–156.058.817, filamento direttoLAMTOR2RAB25: 156.061.147–156.070.514, filamento direttoRAB25MEX3A: 156.072.013–156.082.465, filamento inversoMEX3ALMNA: 156.082.572–156.140.085, filamento direttoLMNASEMA4A: 156.147.366–156.178.869, filamento direttoSEMA4ASLC25A44: 156.193.932–156.212.796, filamento direttoPMF1-BGLAP: 156.212.982–156.243.332, filamento direttoPMF1: 156.212.989–156.240.585, filamento direttoPMF1BGLAP: 156.242.154–156.243.317, filamento direttoBGLAPPAQR6: 156.243.318–156.248.647, filamento inversoPAQR6SMG5: 156.249.224–156.282.825, filamento inversoSMG5TMEM79: 156.282.928–156.293.185, filamento direttoTMEM79GLMP: 156.290.088–156.295.699, filamento inversoGLMPVHLL: 156.298.624–156.299.307, filamento inversoVHLLCCT3: 156.308.792–156.367.873, filamento inversoCCT3TSACC: 156.337.314–156.347.019, filamento direttoTSACCRHBG: 156.369.015–156.385.221, filamento direttoRHBGMEF2D: 156.463.727–156.501.266, filamento inversoMEF2DIQGAP3: 156.525.405–156.572.604, filamento inversoIQGAP3TTC24: 156.579.723–156.587.719, filamento direttoTTC24NAXE: 156.591.738–156.609.507, filamento direttoNAXEGPATCH4: 156.594.301–156.601.496, filamento inversoGPATCH4HAPLN2: 156.619.331–156.626.590, filamento direttoHAPLN2BCAN: 156.641.390–156.659.532, filamento direttoBCANNES: 156.668.763–156.677.415, filamento inversoNESCRABP2: 156.699.592–156.708.094, filamento inversoCRABP2ISG20L2: 156.720.651–156.728.836, filamento inversoISG20L2METTL25B: 156.728.442–156.736.960, filamento direttoMETTL25BMRPL24: 156.737.292–156.741.590, filamento inversoMRPL24HDGF: 156.742.109–156.766.925, filamento inversoPRCC: 156.750.610–156.800.818, filamento direttoDiagramma di SMG5: 22 esoni sul filamento inverso del cromosoma 1Esone 22: 156.249.224–156.250.670, 1447 basiEsone 21: 156.250.858–156.250.996, 139 basiEsone 20: 156.251.403–156.251.477, 75 basiEsone 19: 156.252.414–156.252.504, 91 basiEsone 18: 156.252.919–156.253.078, 160 basiEsone 17: 156.253.449–156.253.508, 60 basiEsone 16: 156.259.005–156.259.163, 159 basiEsone 15: 156.260.451–156.260.626, 176 basiEsone 14: 156.261.333–156.261.408, 76 basiEsone 13: 156.263.395–156.263.570, 176 basiEsone 12: 156.265.781–156.266.380, 600 basiEsone 11: 156.266.541–156.266.678, 138 basiEsone 10: 156.267.470–156.267.678, 209 basiEsone 9: 156.268.115–156.268.183, 69 basiEsone 8: 156.268.290–156.268.415, 126 basiEsone 7: 156.272.320–156.272.398, 79 basiEsone 6: 156.273.361–156.273.450, 90 basiEsone 5: 156.274.597–156.274.686, 90 basiEsone 4: 156.277.085–156.277.241, 157 basiEsone 3: 156.277.925–156.278.048, 124 basiEsone 2: 156.278.936–156.279.034, 99 basiEsone 1: 156.282.607–156.282.825, 219 basi22201816141210864215′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 4,6 kb dei 33,6 kb del gene; 3051 di queste basi codificano la proteina.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.

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Dante Labs. (s.d.). Gene SMG5: SMG5 nonsense mediated mRNA decay factor. Consultato il 16 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/smg5

Vancouver

Dante Labs. Gene SMG5: SMG5 nonsense mediated mRNA decay factor [Internet]. [citato il 16 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/smg5

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