Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

SCAF4

SR-related CTD associated factor 4

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
21q22.11
Koordinaadid
Kromosoom 21: 31 671 000–31 732 118 (GRCh38)
Eksonid
20 eksonit, ulatus 61,1 kb
Valk
1147 aminohapet
Tuntud ka kui
KIAA1172, DKFZp434E098, SRA4
Varasemad tähised
SFRS15
MANE Select transkript
ENST00000286835.12NM_020706.2
Lookuse tüüp
Protein-coding
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni SCAF4 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas SCAF4 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 21, millel on sulg kohal, kus asub SCAF4. SCAF4 ja sellele lähedal asuvad 3 geeni kromosoomil 21, vahemikus 31 201 559 kuni 32 201 558.Kromosoom 2121q22.11p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q21.1q21.2q21.3q22.11q22.12q22.13q22.2q22.331,4 Mb31,6 Mb31,8 Mb32 Mb32,2 MbTIAM1: 31 117 985–31 559 977, pöördne ahelTIAM1SOD1: 31 659 617–31 668 931, otsene ahelSOD1SCAF4: 31 671 000–31 732 118, pöördne ahelSCAF4HUNK: 31 872 805–32 044 633, otsene ahelHUNKSCAF4 skeem: 20 eksonit kromosoomi 21 pöördne ahelalEkson 16: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 15: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 14: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 13: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 12: 8 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 11: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 10: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 8: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 6: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 4: 3 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 20: 31 671 000–31 672 354, 1355 alustEkson 19: 31 685 049–31 685 240, 192 alustEkson 18: 31 685 398–31 685 484, 87 alustEkson 17: 31 685 568–31 685 733, 166 alustEkson 16: 31 688 307–31 688 464, 158 alustEkson 15: 31 690 797–31 690 953, 157 alustEkson 14: 31 691 817–31 691 930, 114 alustEkson 13: 31 692 349–31 692 449, 101 alustEkson 12: 31 693 294–31 693 484, 191 alustEkson 11: 31 694 204–31 694 289, 86 alustEkson 10: 31 694 813–31 694 980, 168 alustEkson 9: 31 696 113–31 696 221, 109 alustEkson 8: 31 696 569–31 696 750, 182 alustEkson 7: 31 700 995–31 701 171, 177 alustEkson 6: 31 701 776–31 701 918, 143 alustEkson 5: 31 702 244–31 702 379, 136 alustEkson 4: 31 703 765–31 703 926, 162 alustEkson 3: 31 705 423–31 705 467, 45 alustEkson 2: 31 706 274–31 706 357, 84 alustEkson 1: 31 731 663–31 732 118, 456 alust201816141210864215′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 4,3 kb kogupikkusega 61,1 kb; neist 3444 alust kodeerivad valku.

Sekveneerimine: SCAF4

25

SCAF4 positsioonid, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu piirkonnas, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.

Terve genoom katab kogu SCAF4 geeni 61,1 kb ulatuses, sealhulgas intronid, mitte ainult 4,3 kb eksoneid.

Geeniga SCAF4 seotud tunnused

Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida SCAF4 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.17-8666dff2.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). SCAF4 geen: SR-related CTD associated factor 4. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/scaf4

Vancouver

Dante Labs. SCAF4 geen: SR-related CTD associated factor 4 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/scaf4

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test