Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

OTOP2

otopetrin 2

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
17q25.1
Koordinaadid
Kromosoom 17: 74 924 273–74 933 912 (GRCh38)
Eksonid
7 eksonit, ulatus 9,6 kb
Valk
562 aminohapet
MANE Select transkript
ENST00000331427.9NM_178160.3
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni OTOP2 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas OTOP2 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 17, millel on sulg kohal, kus asub OTOP2. OTOP2 ja sellele lähedal asuvad 33 geeni kromosoomil 17, vahemikus 74 429 093 kuni 75 429 092.Kromosoom 1717q25.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.374,6 Mb74,8 Mb75 Mb75,2 Mb75,4 MbGPRC5C: 74 424 851–74 459 120, otsene ahelGPRC5CCD300A: 74 466 387–74 506 382, otsene ahelCD300ACD300LB: 74 519 000–74 531 487, pöördne ahelCD300LBCD300C: 74 534 362–74 546 174, pöördne ahelCD300CCD300H: 74 560 701–74 567 343, pöördne ahelCD300HCD300LD: 74 579 365–74 592 283, pöördne ahelCD300LDCD300E: 74 609 878–74 623 857, pöördne ahelCD300ERAB37: 74 670 578–74 747 337, otsene ahelRAB37CD300LF: 74 694 308–74 713 002, pöördne ahelCD300LFNHERF1: 74 748 607–74 769 360, otsene ahelNHERF1NAT9: 74 769 697–74 776 384, pöördne ahelNAT9SLC38A12: 74 776 477–74 839 764, otsene ahelSLC38A12GRIN2C: 74 842 022–74 861 772, pöördne ahelGRIN2CFDXR: 74 862 494–74 873 039, pöördne ahelFDXRFADS6: 74 877 281–74 893 781, pöördne ahelFADS6USH1G: 74 916 083–74 923 256, pöördne ahelUSH1GOTOP2: 74 924 273–74 933 912, otsene ahelOTOP2OTOP3: 74 935 829–74 949 993, otsene ahelOTOP3HID1: 74 950 739–74 973 166, pöördne ahelHID1CDR2L: 74 987 580–75 005 800, otsene ahelCDR2LMRPL58: 75 012 657–75 021 266, otsene ahelMRPL58KCTD2: 75 032 575–75 065 889, otsene ahelKCTD2ATP5PD: 75 038 618–75 047 718, pöördne ahelATP5PDSLC16A5: 75 077 226–75 107 420, otsene ahelSLC16A5ARMC7: 75 109 941–75 130 272, otsene ahelARMC7NT5C: 75 130 225–75 131 806, pöördne ahelNT5CJPT1: 75 135 243–75 168 281, pöördne ahelJPT1SUMO2: 75 165 586–75 182 991, pöördne ahelSUMO2NUP85: 75 205 482–75 235 759, otsene ahelNUP85GGA3: 75 236 595–75 262 363, pöördne ahelGGA3MRPS7: 75 261 662–75 270 708, otsene ahelMRPS7MIF4GD: 75 266 228–75 271 237, pöördne ahelMIF4GDSLC25A19: 75 272 012–75 289 968, pöördne ahelGRB2: 75 318 072–75 405 720, pöördne ahelGRB2OTOP2 skeem: 7 eksonit kromosoomi 17 otsene ahelalEkson 1: 74 924 273–74 924 333, 61 alustEkson 2: 74 924 600–74 924 945, 346 alustEkson 3: 74 925 556–74 925 692, 137 alustEkson 4: 74 927 223–74 927 281, 59 alustEkson 5: 74 927 665–74 927 798, 134 alustEkson 6: 74 930 279–74 931 153, 875 alustEkson 7: 74 933 375–74 933 912, 538 alust12345675′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 2,2 kb kogupikkusega 9,6 kb; neist 1689 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse OTOP2

1

koht geenis OTOP2, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni OTOP2 9,6 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (2,2 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). OTOP2 geen: otopetrin 2. Vaadatud 16. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/otop2

Vancouver

Dante Labs. OTOP2 geen: otopetrin 2 [Internet]. [viidatud 16. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/otop2

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test