Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi

Geeni

OTOP2

otopetrin 2

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
17q25.1
Koordinaatit
Kromosomi 17: 74 924 273–74 933 912 (GRCh38)
Eksonit
7 eksonia 9,6 kb:n alueella
Proteiini
562 aminohappoa
MANE Select -transkripti
ENST00000331427.9NM_178160.3
Lokustyyppi
gene with protein product
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

ViitegenomiGRCh38

Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä OTOP2. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

OTOP2-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 17, jossa hakasulke osoittaa OTOP2-geenin sijainnin. OTOP2 ja 33 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 17, välillä 74 429 093–75 429 092.Kromosomi 1717q25.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.374,6 Mb74,8 Mb75 Mb75,2 Mb75,4 MbGPRC5C: 74 424 851–74 459 120, juoste eteenpäinGPRC5CCD300A: 74 466 387–74 506 382, juoste eteenpäinCD300ACD300LB: 74 519 000–74 531 487, juoste taaksepäinCD300LBCD300C: 74 534 362–74 546 174, juoste taaksepäinCD300CCD300H: 74 560 701–74 567 343, juoste taaksepäinCD300HCD300LD: 74 579 365–74 592 283, juoste taaksepäinCD300LDCD300E: 74 609 878–74 623 857, juoste taaksepäinCD300ERAB37: 74 670 578–74 747 337, juoste eteenpäinRAB37CD300LF: 74 694 308–74 713 002, juoste taaksepäinCD300LFNHERF1: 74 748 607–74 769 360, juoste eteenpäinNHERF1NAT9: 74 769 697–74 776 384, juoste taaksepäinNAT9SLC38A12: 74 776 477–74 839 764, juoste eteenpäinSLC38A12GRIN2C: 74 842 022–74 861 772, juoste taaksepäinGRIN2CFDXR: 74 862 494–74 873 039, juoste taaksepäinFDXRFADS6: 74 877 281–74 893 781, juoste taaksepäinFADS6USH1G: 74 916 083–74 923 256, juoste taaksepäinUSH1GOTOP2: 74 924 273–74 933 912, juoste eteenpäinOTOP2OTOP3: 74 935 829–74 949 993, juoste eteenpäinOTOP3HID1: 74 950 739–74 973 166, juoste taaksepäinHID1CDR2L: 74 987 580–75 005 800, juoste eteenpäinCDR2LMRPL58: 75 012 657–75 021 266, juoste eteenpäinMRPL58KCTD2: 75 032 575–75 065 889, juoste eteenpäinKCTD2ATP5PD: 75 038 618–75 047 718, juoste taaksepäinATP5PDSLC16A5: 75 077 226–75 107 420, juoste eteenpäinSLC16A5ARMC7: 75 109 941–75 130 272, juoste eteenpäinARMC7NT5C: 75 130 225–75 131 806, juoste taaksepäinNT5CJPT1: 75 135 243–75 168 281, juoste taaksepäinJPT1SUMO2: 75 165 586–75 182 991, juoste taaksepäinSUMO2NUP85: 75 205 482–75 235 759, juoste eteenpäinNUP85GGA3: 75 236 595–75 262 363, juoste taaksepäinGGA3MRPS7: 75 261 662–75 270 708, juoste eteenpäinMRPS7MIF4GD: 75 266 228–75 271 237, juoste taaksepäinMIF4GDSLC25A19: 75 272 012–75 289 968, juoste taaksepäinGRB2: 75 318 072–75 405 720, juoste taaksepäinGRB2OTOP2-kaavio: 7 eksonia kromosomin 17 juosteella, eteenpäinEkson 1: 74 924 273–74 924 333, 61 emästäEkson 2: 74 924 600–74 924 945, 346 emästäEkson 3: 74 925 556–74 925 692, 137 emästäEkson 4: 74 927 223–74 927 281, 59 emästäEkson 5: 74 927 665–74 927 798, 134 emästäEkson 6: 74 930 279–74 931 153, 875 emästäEkson 7: 74 933 375–74 933 912, 538 emästä12345675′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 2,2 kb geenin 9,6 kb:stä; 1 689 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

Miten genomitesti lukee geeniä OTOP2

1

OTOP2-geenin kohta, jossa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi

Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.

Kokogenomi kattaa kaikki 9,6 kb geenistä OTOP2, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 2,2 kb eksoneja.

Mistä tieto on peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
  • Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). OTOP2-geeni: otopetrin 2. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/otop2

Vancouver

Dante Labs. OTOP2-geeni: otopetrin 2 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/otop2

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test