Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

LIMS2

LIM zinc finger domain containing 2

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
2q14.3
Koordinaadid
Kromosoom 2: 127 638 426–127 675 530 (GRCh38)
Eksonid
10 eksonit, ulatus 37,1 kb
Valk
341 aminohapet
Tuntud ka kui
PINCH2, PINCH-2
MANE Select transkript
ENST00000355119.9NM_001161403.3
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni LIMS2 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas LIMS2 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 2, millel on sulg kohal, kus asub LIMS2. LIMS2 ja sellele lähedal asuvad 13 geeni kromosoomil 2, vahemikus 127 156 978 kuni 128 156 977.Kromosoom 22q14.3p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23.3p23.2p23.1p22.3p22.2p22.1p21p16.3p16.2p16.1p15p14p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13q14.1q14.2q14.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q34q35q36.1q36.2q36.3q37.1q37.2q37.3127,2 Mb127,4 Mb127,6 Mb127,8 Mb128 MbCYP27C1: 127 183 832–127 220 385, pöördne ahelCYP27C1ERCC3: 127 257 285–127 294 188, pöördne ahelERCC3MAP3K2: 127 298 668–127 388 465, pöördne ahelMAP3K2PROC: 127 415 933–127 429 762, otsene ahelPROCIWS1: 127 436 207–127 526 886, pöördne ahelIWS1MYO7B: 127 535 683–127 637 729, otsene ahelMYO7BLIMS2: 127 638 426–127 675 530, pöördne ahelLIMS2GPR17: 127 645 864–127 656 181, otsene ahelGPR17WDR33: 127 701 027–127 811 195, pöördne ahelWDR33SFT2D3: 127 701 497–127 705 242, otsene ahelSFT2D3POLR2D: 127 843 553–127 858 163, pöördne ahelPOLR2DAMMECR1L: 127 861 630–127 885 967, pöördne ahelAMMECR1LSAP130: 127 941 217–128 028 124, pöördne ahelSAP130UGGT1: 128 091 151–128 195 677, otsene ahelUGGT1LIMS2 skeem: 10 eksonit kromosoomi 2 pöördne ahelalEkson 5: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 10: 127 638 426–127 639 428, 1003 alustEkson 9: 127 640 070–127 640 145, 76 alustEkson 8: 127 640 270–127 640 318, 49 alustEkson 7: 127 640 896–127 640 988, 93 alustEkson 6: 127 642 049–127 642 199, 151 alustEkson 5: 127 642 923–127 643 072, 150 alustEkson 4: 127 654 424–127 654 544, 121 alustEkson 3: 127 654 830–127 654 896, 67 alustEkson 2: 127 657 403–127 657 562, 160 alustEkson 1: 127 675 014–127 675 530, 517 alust10864215′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 2,4 kb kogupikkusega 37,1 kb; neist 1026 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse LIMS2

2

kohad geenis LIMS2, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni LIMS2 37,1 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (2,4 kb).

Geeniga LIMS2 seotud tunnused

Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida LIMS2 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). LIMS2 geen: LIM zinc finger domain containing 2. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/lims2

Vancouver

Dante Labs. LIMS2 geen: LIM zinc finger domain containing 2 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/lims2

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test