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Gène

LIMS2

LIM zinc finger domain containing 2

Résumé

Localisation cytogénétique
2q14.3
Coordonnées
Chromosome 2 : 127 638 426–127 675 530 (GRCh38)
Exons
10 exons sur 37,1 kb
Protéine
341 acides aminés
Aussi appelé
PINCH2, PINCH-2
Transcrit MANE Select
ENST00000355119.9NM_001161403.3
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore LIMS2. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de LIMS2

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 2, avec un crochet à l'emplacement de LIMS2. LIMS2 et 13 gènes à proximité sur le chromosome 2, de 127 156 978 à 128 156 977.Chromosome 22q14.3p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23.3p23.2p23.1p22.3p22.2p22.1p21p16.3p16.2p16.1p15p14p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13q14.1q14.2q14.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q33.1q33.2q33.3q34q35q36.1q36.2q36.3q37.1q37.2q37.3127,2 Mb127,4 Mb127,6 Mb127,8 Mb128 MbCYP27C1 : 127 183 832–127 220 385, brin inverseCYP27C1ERCC3 : 127 257 285–127 294 188, brin inverseERCC3MAP3K2 : 127 298 668–127 388 465, brin inverseMAP3K2PROC : 127 415 933–127 429 762, brin directPROCIWS1 : 127 436 207–127 526 886, brin inverseIWS1MYO7B : 127 535 683–127 637 729, brin directMYO7BLIMS2 : 127 638 426–127 675 530, brin inverseLIMS2GPR17 : 127 645 864–127 656 181, brin directGPR17WDR33 : 127 701 027–127 811 195, brin inverseWDR33SFT2D3 : 127 701 497–127 705 242, brin directSFT2D3POLR2D : 127 843 553–127 858 163, brin inversePOLR2DAMMECR1L : 127 861 630–127 885 967, brin inverseAMMECR1LSAP130 : 127 941 217–128 028 124, brin inverseSAP130UGGT1 : 128 091 151–128 195 677, brin directUGGT1Schéma de LIMS2 : 10 exons sur le brin inverse du chromosome 2Exon 5 : 1 site connu associé à une maladieExon 10 : 127 638 426–127 639 428, 1 003 basesExon 9 : 127 640 070–127 640 145, 76 basesExon 8 : 127 640 270–127 640 318, 49 basesExon 7 : 127 640 896–127 640 988, 93 basesExon 6 : 127 642 049–127 642 199, 151 basesExon 5 : 127 642 923–127 643 072, 150 basesExon 4 : 127 654 424–127 654 544, 121 basesExon 3 : 127 654 830–127 654 896, 67 basesExon 2 : 127 657 403–127 657 562, 160 basesExon 1 : 127 675 014–127 675 530, 517 bases10864215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,4 kb sur les 37,1 kb du gène ; 1 026 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit LIMS2

2

positions dans LIMS2 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 37,1 kb de LIMS2, introns compris, et pas seulement les 2,4 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène LIMS2 : LIM zinc finger domain containing 2. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/lims2

Vancouver

Dante Labs. Gène LIMS2 : LIM zinc finger domain containing 2 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/lims2

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