Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

HAVCR2

hepatitis A virus cellular receptor 2

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
5q33.3
Koordinaadid
Kromosoom 5: 157 085 832–157 109 044 (GRCh38)
Eksonid
7 eksonit, ulatus 23,2 kb
Valk
301 aminohapet
Tuntud ka kui
Tim-3, TIM3, FLJ14428, TIMD3, CD366
MANE Select transkript
ENST00000307851.9NM_032782.5
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni HAVCR2 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas HAVCR2 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 5, millel on sulg kohal, kus asub HAVCR2. HAVCR2 ja sellele lähedal asuvad 12 geeni kromosoomil 5, vahemikus 156 597 438 kuni 157 597 437.Kromosoom 55q33.3p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.3156,6 Mb156,8 Mb157 Mb157,2 Mb157,4 MbSGCD: 155 870 344–156 767 788, otsene ahelSGCDPPP1R2B: 156 850 295–156 852 528, otsene ahelPPP1R2BTIMD4: 156 918 639–156 963 230, pöördne ahelTIMD4HAVCR1: 157 025 939–157 069 396, pöördne ahelHAVCR1HAVCR2: 157 085 832–157 109 044, pöördne ahelHAVCR2MED7: 157 134 848–157 159 019, pöördne ahelMED7ITK: 157 142 933–157 255 185, otsene ahelITKGARIN3: 157 161 846–157 166 264, pöördne ahelGARIN3CYFIP2: 157 266 079–157 395 595, otsene ahelCYFIP2: 157 341 596–157 460 100, pöördne ahelFNDC9: 157 341 598–157 345 766, pöördne ahelFNDC9ADAM19: 157 395 534–157 575 858, pöördne ahelADAM19NIPAL4: 157 460 213–157 474 723, otsene ahelNIPAL4HAVCR2 skeem: 7 eksonit kromosoomi 5 pöördne ahelalEkson 2: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 7: 157 085 832–157 087 294, 1463 alustEkson 6: 157 088 941–157 088 977, 37 alustEkson 5: 157 095 306–157 095 459, 154 alustEkson 4: 157 098 858–157 098 901, 44 alustEkson 3: 157 104 666–157 104 749, 84 alustEkson 2: 157 106 627–157 106 962, 336 alustEkson 1: 157 108 926–157 109 044, 119 alust76543215′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 2,2 kb kogupikkusega 23,2 kb; neist 906 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse HAVCR2

1

koht geenis HAVCR2, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni HAVCR2 23,2 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (2,2 kb).

Geeniga HAVCR2 seotud tunnused

Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida HAVCR2 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). HAVCR2 geen: hepatitis A virus cellular receptor 2. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/havcr2

Vancouver

Dante Labs. HAVCR2 geen: hepatitis A virus cellular receptor 2 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/havcr2

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test