Revisto por pares · Scientific Reports · 2026
Liver transcriptome dynamics in Holstein cows during the periparturient transition
O estudo comparou a expressão génica no fígado de seis vacas Holstein antes e depois do parto, para compreender como o órgão se adapta ao início da lactação. Foram identificados 198 genes com expressão diferencial, observando-se uma mudança no sentido da produção de energia e da sobrevivência celular, em detrimento do armazenamento e do crescimento.
Bhowmik et al.
O estudo comparou a expressão génica no fígado de seis vacas Holstein antes e depois do parto, para compreender como o órgão se adapta ao início da lactação. Foram identificados 198 genes com expressão diferencial, observando-se uma mudança no sentido da produção de energia e da sobrevivência celular, em detrimento do armazenamento e do crescimento.
Participação da Dante Labs
A Dante Labs realizou a extração e a sequenciação de RNA para este estudo, no âmbito de um serviço contratado de RNA-seq. As doze amostras de tecido hepático congelado foram-nos enviadas, e o RNA total foi extraído no âmbito do serviço contratado, de acordo com os nossos protocolos internos normalizados. A quantidade de RNA foi avaliada por espectrofotometria e a integridade do RNA através de um sistema automatizado de eletroforese, tendo todas as amostras cumprido os limiares de qualidade para sequenciação. O artigo não especifica a química de extração nem o kit utilizado.
As bibliotecas de cada amostra de tecido foram preparadas utilizando o Illumina Ribo-Zero Plus rRNA Depletion Kit e sequenciadas numa plataforma Illumina NovaSeq, com leituras de 2 × 150 bp, produzindo pelo menos 6,5 Gb de dados de RNA-seq por biblioteca. Entregámos os ficheiros FASTQ em bruto à equipa de investigação, que realizou todas as análises bioinformáticas subsequentes.
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