Peer-Review · Scientific Reports · 2026
Liver transcriptome dynamics in Holstein cows during the periparturient transition
In der Studie wurde die Genexpression in der Leber von sechs Holstein-Kühen vor und nach dem Kalben verglichen, um zu untersuchen, wie sich das Organ an die frühe Laktation anpasst. Dabei wurden 198 unterschiedlich exprimierte Gene identifiziert. Die Genaktivität verlagerte sich von Speicherung und Wachstum hin zu Energiegewinnung und Zellüberleben.
Bhowmik et al.
In der Studie wurde die Genexpression in der Leber von sechs Holstein-Kühen vor und nach dem Kalben verglichen, um zu untersuchen, wie sich das Organ an die frühe Laktation anpasst. Dabei wurden 198 unterschiedlich exprimierte Gene identifiziert. Die Genaktivität verlagerte sich von Speicherung und Wachstum hin zu Energiegewinnung und Zellüberleben.
Beteiligung von Dante Labs
Dante Labs führte im Rahmen einer beauftragten RNA-seq-Dienstleistung die RNA-Extraktion und Sequenzierung für diese Studie durch. Alle zwölf gefrorenen Lebergewebeproben wurden an uns geschickt, und die Gesamt-RNA wurde im Rahmen der beauftragten Dienstleistung gemäß unseren internen Standardprotokollen extrahiert. Die RNA-Menge wurde mittels Spektrophotometrie und die RNA-Integrität mithilfe eines automatisierten Elektrophoresesystems bestimmt. Alle Proben erfüllten die Qualitätsanforderungen für die Sequenzierung. In der Publikation wird nicht angegeben, welche Extraktionschemie oder welches Kit verwendet wurde.
Die Bibliotheken für jede Gewebeprobe wurden mit dem Illumina Ribo-Zero Plus rRNA Depletion Kit erstellt und auf einer Illumina NovaSeq-Plattform mit 2 × 150 bp langen Reads sequenziert. Dabei entstanden pro Bibliothek mindestens 6.5 Gb RNA-seq-Daten. Wir stellten dem Forschungsteam die FASTQ-Rohdateien zur Verfügung; sämtliche nachgelagerten bioinformatischen Analysen wurden vom Forschungsteam durchgeführt.
Weitere Publikationen
Peer-Review · Clinical Case Reports · 2026
Unveiling New Insights: Reinterpreting DES Mutation, p.Arg383His, Through a Study of an Iranian Family With Isolated Hypertrophic Cardiomyopathy, Implication for Phenotype–Genotype Correlation Analysis
Peer-Review · International Journal of Genomics · 2026
Alport Syndrome–Associated Pathogenic COL4A4 Variant in Sisters With Chronic Kidney Disease: Clinical Findings and Integrative Network Analysis
Peer-Review · Biology · 2026
Why Should a Genome Be Protected? Ethical, Legal, and Security Challenges in the Protection of Genomic Data
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