Évalué par les pairs · Scientific Reports · 2026
Liver transcriptome dynamics in Holstein cows during the periparturient transition
L’étude a comparé l’expression des gènes dans le foie de six vaches Holstein avant et après le vêlage afin de déterminer comment cet organe s’adapte au début de la lactation. Elle a identifié 198 gènes exprimés différemment, avec une réorientation vers la production d’énergie et la survie cellulaire plutôt que vers le stockage et la croissance.
Bhowmik et al.
L’étude a comparé l’expression des gènes dans le foie de six vaches Holstein avant et après le vêlage afin de déterminer comment cet organe s’adapte au début de la lactation. Elle a identifié 198 gènes exprimés différemment, avec une réorientation vers la production d’énergie et la survie cellulaire plutôt que vers le stockage et la croissance.
Participation de Dante Labs
Dante Labs a réalisé l’extraction et le séquençage de l’ARN pour cette étude dans le cadre d’une prestation de service RNA-seq. Les douze échantillons de tissu hépatique congelé nous ont été expédiés, et l’ARN total a été extrait dans le cadre de cette prestation, conformément à nos protocoles standards internes. La quantité d’ARN a été évaluée par spectrophotométrie et son intégrité à l’aide d’un système d’électrophorèse automatisé. Tous les échantillons satisfaisaient aux seuils de qualité requis pour le séquençage. L’article ne précise ni la méthode chimique d’extraction ni le kit utilisé.
Les banques de chaque échantillon de tissu ont été préparées à l’aide de l’Illumina Ribo-Zero Plus rRNA Depletion Kit, puis séquencées sur une plateforme Illumina NovaSeq avec des lectures de 2 × 150 bp, générant au moins 6.5 Gb de données RNA-seq par banque. Nous avons remis les fichiers FASTQ bruts à l’équipe de recherche, qui a réalisé l’ensemble des analyses bio-informatiques en aval.
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