Gen
MST1R
macrophage stimulating 1 receptor
- HGNC 7381↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000164078↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 4486↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 3p21.31
- Koordinater
- Kromosom 3: 49 887 002–49 903 873 (GRCh38)
- Eksoner
- 20 eksoner over 16,9 kb
- Protein
- 1 400 aminosyrer
- Også kjent som
- CDw136, CD136
- Tidligere symboler
- RON, PTK8, SEA
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000296474.8NM_002447.4
- Lokustype
- Proteinkodende
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/mst1r.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes MST1R og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuraterte rapporter som er relevante for dette genet
Ingen Genome Test-rapport leser MST1R ennå. Testen sekvenserer hele genomet ditt, så dataene dine inkluderer det likevel.
Slik er MST1R bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 4,8 kb av genets 16,9 kb, og 4 203 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av MST1R
4Lett
Hvor vanskelig MST1R er å sekvensere med korte leser, av 100
0 · Lett100 · Vanskelig
Nesten alle eksonene til MST1R ligger der korte leser kartlegges godt.
Det som bidrar: andelen av eksonene til MST1R i hver type vanskelig område
- KartleggbarhetStrekninger der 100 eller 250 bp lange leser ikke kan plasseres entydig, slik at en påvisning der kan mangle eller være feil. Vekt 100 %.0 %
- HomologiSegmentelle duplikasjoner: kopier andre steder i genomet, som paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vekt 60 %.0 %
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Vekt 60 %.0 %
- ReferansedekningHull i den nærliggende referanseassembleringen, der det ikke finnes sekvens for leser å justere mot. Vekt 50 %.0 %
- RepetisjonerTandemrepetisjoner og serier av én base, som leser kan glippe på og kanskje ikke spenner over. Vekt 30 %.0,9 %
- GC-innholdVinduer med under 25 % eller over 65 % G og C, som bibliotekforberedelsen dekker tynt. Vekt 20 %.20 %
En Dante Labs-score basert på egen forskning, bygget på NISTs Genome in a Bottle-kart over vanskelig sekvenserbare områder.Slik beregnes poengsummenHver søyle er andelen av eksonbaser i MST1R i den typen vanskelig område. Én type kan i seg selv gjøre et gen vanskelig, og hver ekstra type bidrar mindre: 0 når ingen baser er i noen, 100 når alle baser ligger der leser ikke kan plasseres entydig.
Egenskaper knyttet til MST1R
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene MST1R kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Her kommer dette fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
- Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). MST1R-genet: macrophage stimulating 1 receptor. Hentet 19. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/mst1r
Dante Labs. MST1R-genet: macrophage stimulating 1 receptor [Internett]. [sitert 19. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/mst1r
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker