Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

ARID3C

AT-rich interaction domain 3C

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
9p13.3
Koordináták
9. kromoszóma: 34 621 049–34 629 066 (GRCh38)
Exonok
8 exon, összesen 8 kb
Fehérje
412 aminosav
MANE Select transzkriptum
ENST00000378909.4NM_001017363.4
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) ARID3C gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A ARID3C felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
9. kromoszóma, a ARID3C helyét zárójel jelöli. A ARID3C és környékén 31 gén a 9. kromoszómán, 34 125 058–35 125 057 között.9. kromoszóma9p13.3p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q13q21.11q21.12q21.13q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34.11q34.12q34.13q34.2q34.334,2 Mb34,4 Mb34,6 Mb34,8 Mb35 MbDCAF12: 34 086 384–34 127 399, fordított szálDCAF12UBAP1: 34 179 005–34 252 523, előre szálUBAP1KIF24: 34 248 327–34 329 282, fordított szálKIF24NUDT2: 34 329 496–34 343 713, előre szálNUDT2MYORG: 34 366 623–34 377 150, fordított szálMYORGSPMIP6: 34 379 019–34 397 828, fordított szálSPMIP6FAM219A: 34 398 184–34 458 591, fordított szálFAM219ADNAI1: 34 457 414–34 520 988, előre szálDNAI1ENHO: 34 521 043–34 523 174, fordított szálENHOCNTFR: 34 551 423–34 593 478, fordított szálCNTFRRPP25L: 34 610 486–34 612 605, fordított szálRPP25LDCTN3: 34 613 545–34 620 529, fordított szálDCTN3ARID3C: 34 621 049–34 629 066, fordított szálARID3CSIGMAR1: 34 631 716–34 637 844, fordított szálSIGMAR1GALT: 34 637 367–34 651 754, előre szál: 34 646 631–34 661 886, előre szálIL11RA: 34 651 582–34 661 902, előre szálCCL27: 34 661 880–34 664 048, fordított szál: 34 664 163–34 666 122, fordított szálCCL19: 34 689 562–34 691 355, fordított szálCCL21: 34 709 005–34 710 167, fordított szálCCL21SPATA31F1: 34 719 196–34 729 538, fordított szálSPATA31F1SPATA31F3: 34 889 062–34 895 797, fordított szálSPATA31F3PHF24: 34 957 608–34 982 544, előre szálPHF24DNAJB5: 34 989 641–34 999 403, előre szálDNAJB5SPATA31G1: 35 041 095–35 045 986, előre szálSPATA31G1VCP: 35 053 928–35 072 725, fordított szálVCP: 35 065 339–35 074 175, fordított szálFANCG: 35 073 793–35 082 444, fordított szálFANCGPIGO: 35 085 492–35 096 632, fordított szálSTOML2: 35 099 469–35 103 195, fordított szálATOSB: 35 104 112–35 116 357, fordított szálATOSBA ARID3C ábrája: 8 exon a(z) 9. kromoszóma fordított szálán8. exon: 34 621 049–34 621 558, 510 bázis7. exon: 34 622 020–34 622 109, 90 bázis6. exon: 34 622 347–34 622 529, 183 bázis5. exon: 34 623 425–34 623 714, 290 bázis4. exon: 34 623 864–34 624 047, 184 bázis3. exon: 34 625 742–34 625 814, 73 bázis2. exon: 34 627 697–34 628 086, 390 bázis1. exon: 34 628 917–34 629 066, 150 bázis876543215′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 8 kb-jából 1,9 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1239 bázis kódolja a fehérjét.

ARID3C szekvenálása

11Könnyű

Mennyire nehéz a ARID3C szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból

A ARID3C exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ami tovább nehezíti: a ARID3C exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Shared with chrY0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések4,6%
  • GC-tartalom47%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). ARID3C gén: AT-rich interaction domain 3C. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/arid3c

Vancouver

Dante Labs. ARID3C gén: AT-rich interaction domain 3C [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/arid3c

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet