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Gène

VPS25

vacuolar protein sorting 25 homolog

Résumé

Localisation cytogénétique
17q21.31
Coordonnées
Chromosome 17 : 42 773 449–42 779 599 (GRCh38)
Exons
6 exons sur 6,2 kb
Protéine
176 acides aminés
Aussi appelé
MGC10540, EAP20, DERP9
Transcrit MANE Select
ENST00000253794.7NM_032353.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

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Structure de VPS25

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
Chromosome 17, avec un crochet à l'emplacement de VPS25. VPS25 et 38 gènes à proximité sur le chromosome 17, de 42 276 524 à 43 276 523.Chromosome 1717q21.31p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.342,4 Mb42,6 Mb42,8 Mb43 Mb43,2 MbSTAT5B : 42 199 176–42 288 633, brin inverseSTAT5BSTAT5A : 42 287 547–42 311 943, brin directSTAT5ASTAT3 : 42 313 322–42 388 574, brin inverseSTAT3CAVIN1 : 42 402 449–42 423 322, brin inverseCAVIN1ATP6V0A1 : 42 458 823–42 522 582, brin directATP6V0A1NAGLU : 42 536 216–42 544 449, brin directHSD17B1 : 42 552 920–42 555 217, brin directCOASY : 42 561 467–42 566 277, brin directMLX : 42 567 067–42 573 239, brin directMLXPSMC3IP : 42 572 310–42 577 831, brin inversePSMC3IPRETREG3 : 42 579 508–42 610 623, brin inverseRETREG3TUBG1 : 42 609 411–42 615 253, brin directTUBG1TUBG2 : 42 659 223–42 667 007, brin directTUBG2PLEKHH3 : 42 667 914–42 677 064, brin inversePLEKHH3CCR10 : 42 678 889–42 683 917, brin inverseCCR10CNTNAP1 : 42 682 368–42 699 993, brin directCNTNAP1EZH1 : 42 700 270–42 745 069, brin inverseEZH1RAMP2 : 42 758 447–42 763 537, brin directRAMP2VPS25 : 42 773 449–42 779 599, brin directVPS25WNK4 : 42 780 593–42 797 066, brin directWNK4COA3 : 42 793 154–42 798 719, brin inverseCOA3CNTD1 : 42 798 800–42 811 587, brin directBECN1 : 42 809 108–42 833 350, brin inverseBECN1PSME3 : 42 824 385–42 843 760, brin directAOC2 : 42 844 574–42 850 707, brin directAOC2AOC3 : 42 851 130–42 858 130, brin directAOC3G6PC1 : 42 900 722–42 923 502, brin directG6PC1AARSD1 : 42 950 424–42 964 498, brin inverseAARSD1PTGES3L-AARSD1 : 42 950 526–42 980 528, brin inversePTGES3L-AARSD1PTGES3L : 42 968 035–42 980 502, brin inversePTGES3LRUNDC1 : 42 980 552–42 995 142, brin directRUNDC1RPL27 : 42 998 265–43 002 973, brin directVAT1 : 42 999 182–43 025 123, brin inverseIFI35 : 43 006 740–43 014 638, brin directRND2 : 43 025 210–43 047 509, brin directBRCA1 : 43 044 292–43 170 245, brin inverseBRCA1NBR1 : 43 170 317–43 211 690, brin directNBR1TMEM106A : 43 211 835–43 220 041, brin directTMEM106ACCDC200 : 43 216 941–43 305 397, brin inverseCCDC200Schéma de VPS25 : 6 exons sur le brin direct du chromosome 17Exon 1 : 42 773 449–42 773 528, 80 basesExon 2 : 42 773 733–42 773 878, 146 basesExon 3 : 42 774 646–42 774 699, 54 basesExon 4 : 42 775 381–42 775 469, 89 basesExon 5 : 42 776 245–42 776 320, 76 basesExon 6 : 42 778 957–42 779 599, 643 bases1234565′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 1,1 kb sur les 6,2 kb du gène ; 531 de ces bases codent pour la protéine.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

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Dante Labs. (s.d.). Gène VPS25 : vacuolar protein sorting 25 homolog. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/vps25

Vancouver

Dante Labs. Gène VPS25 : vacuolar protein sorting 25 homolog [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/vps25

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