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Gène

SIPA1L3

signal induced proliferation associated 1 like 3

Résumé

Localisation cytogénétique
19q13.13-q13.2
Coordonnées
Chromosome 19 : 37 907 208–38 208 369 (GRCh38)
Exons
22 exons sur 301,2 kb
Protéine
1 781 acides aminés
Aussi appelé
KIAA0545, SPAR3
Transcrit MANE Select
ENST00000222345.11NM_015073.3
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore SIPA1L3. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de SIPA1L3

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 19, avec un crochet à l'emplacement de SIPA1L3. SIPA1L3 et 21 gènes à proximité sur le chromosome 19, de 37 557 789 à 38 557 788.Chromosome 1919q13.13-q13.2p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12p11q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q13.41q13.42q13.4337,6 Mb37,8 Mb38 Mb38,2 Mb38,4 MbZNF540 : 37 551 406–37 614 179, brin directZNF540ZNF571 : 37 554 780–37 595 147, brin inverseZNF571ZFP30 : 37 613 645–37 692 337, brin inverseZFP30 : 37 689 865–37 719 188, brin inverseZNF607 : 37 696 349–37 719 780, brin inverseZNF607ZNF573 : 37 735 833–37 817 300, brin inverseZNF573WDR87 : 37 884 823–37 906 677, brin inverseWDR87SIPA1L3 : 37 907 208–38 208 369, brin directSIPA1L3DPF1 : 38 211 006–38 229 729, brin inverseDPF1SPINT2 : 38 244 035–38 292 615, brin directSPINT2PPP1R14A : 38 250 856–38 256 615, brin inversePPP1R14A : 38 289 151–38 304 910, brin directYIF1B : 38 303 558–38 317 273, brin inverseC19orf33 : 38 304 158–38 305 011, brin directC19orf33KCNK6 : 38 319 813–38 333 553, brin directKCNK6CATSPERG : 38 335 775–38 370 943, brin directCATSPERGPSMD8 : 38 374 563–38 383 850, brin directPSMD8GGN : 38 384 267–38 388 274, brin inverseGGNSPRED3 : 38 388 421–38 399 588, brin directSPRED3TSLIG3C : 38 403 093–38 409 088, brin directRASGRP4 : 38 409 051–38 426 305, brin inverseRYR1 : 38 433 691–38 595 273, brin directRYR1Schéma de SIPA1L3 : 22 exons sur le brin direct du chromosome 19Exon 12 : 1 site connu associé à une maladieExon 1 : 37 907 208–37 907 358, 151 basesExon 2 : 38 029 089–38 029 156, 68 basesExon 3 : 38 081 256–38 083 099, 1 844 basesExon 4 : 38 088 721–38 088 851, 131 basesExon 5 : 38 099 962–38 100 150, 189 basesExon 6 : 38 101 052–38 101 226, 175 basesExon 7 : 38 106 537–38 106 640, 104 basesExon 8 : 38 110 227–38 110 384, 158 basesExon 9 : 38 119 306–38 119 882, 577 basesExon 10 : 38 130 498–38 130 772, 275 basesExon 11 : 38 141 184–38 141 435, 252 basesExon 12 : 38 142 573–38 142 710, 138 basesExon 13 : 38 152 840–38 152 967, 128 basesExon 14 : 38 162 253–38 162 371, 119 basesExon 15 : 38 164 479–38 164 906, 428 basesExon 16 : 38 182 519–38 182 740, 222 basesExon 17 : 38 192 145–38 192 310, 166 basesExon 18 : 38 193 537–38 193 780, 244 basesExon 19 : 38 198 389–38 198 532, 144 basesExon 20 : 38 201 862–38 201 997, 136 basesExon 21 : 38 204 127–38 204 208, 82 basesExon 22 : 38 206 097–38 208 369, 2 273 bases1225′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 8 kb sur les 301,2 kb du gène ; 5 346 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit SIPA1L3

1

position dans SIPA1L3 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 301,2 kb de SIPA1L3, introns compris, et pas seulement les 8 kb d'exons.

Traits associés à SIPA1L3

L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que SIPA1L3 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.

Liens externes

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène SIPA1L3 : signal induced proliferation associated 1 like 3. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/sipa1l3

Vancouver

Dante Labs. Gène SIPA1L3 : signal induced proliferation associated 1 like 3 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/sipa1l3

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