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Gène

BDP1

BDP1 general transcription factor IIIB subunit

Résumé

Localisation cytogénétique
5q13.2
Coordonnées
Chromosome 5 : 71 455 651–71 567 820 (GRCh38)
Exons
39 exons sur 112,2 kb
Protéine
2 624 acides aminés
Aussi appelé
TFC5, KIAA1241, KIAA1689, HSA238520, TFIIIB150
Symboles précédents
TFNR, TAF3B1
Transcrit MANE Select
ENST00000358731.9NM_018429.3
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore BDP1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de BDP1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 5, avec un crochet à l'emplacement de BDP1. BDP1 et 4 gènes à proximité sur le chromosome 5, de 71 011 736 à 72 011 735.Chromosome 55q13.2p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.371,2 Mb71,4 Mb71,6 Mb71,8 Mb72 MbNAIP : 70 968 166–71 025 339, brin inverseNAIPGTF2H2 : 71 034 962–71 067 723, brin inverseGTF2H2BDP1 : 71 455 651–71 567 820, brin directBDP1MCCC2 : 71 579 531–71 658 706, brin directMCCC2CARTPT : 71 719 126–71 721 056, brin directCARTPTSchéma de BDP1 : 39 exons sur le brin direct du chromosome 5Exon 25 : 1 site connu associé à une maladieExon 37 : 1 site connu associé à une maladieExon 1 : 71 455 651–71 456 089, 439 basesExon 2 : 71 458 579–71 458 855, 277 basesExon 3 : 71 461 817–71 461 926, 110 basesExon 4 : 71 464 058–71 464 117, 60 basesExon 5 : 71 466 096–71 466 221, 126 basesExon 6 : 71 467 354–71 467 487, 134 basesExon 7 : 71 470 395–71 470 489, 95 basesExon 8 : 71 483 842–71 483 896, 55 basesExon 9 : 71 486 484–71 486 627, 144 basesExon 10 : 71 489 404–71 489 682, 279 basesExon 11 : 71 490 984–71 491 131, 148 basesExon 12 : 71 495 250–71 495 408, 159 basesExon 13 : 71 497 270–71 497 426, 157 basesExon 14 : 71 501 562–71 501 653, 92 basesExon 15 : 71 502 599–71 502 791, 193 basesExon 16 : 71 504 621–71 504 751, 131 basesExon 17 : 71 509 465–71 511 151, 1 687 basesExon 18 : 71 512 241–71 512 428, 188 basesExon 19 : 71 513 185–71 513 407, 223 basesExon 20 : 71 514 944–71 515 122, 179 basesExon 21 : 71 516 061–71 516 271, 211 basesExon 22 : 71 517 322–71 517 452, 131 basesExon 23 : 71 522 289–71 522 490, 202 basesExon 24 : 71 522 756–71 522 949, 194 basesExon 25 : 71 523 939–71 524 323, 385 basesExon 26 : 71 532 308–71 532 427, 120 basesExon 27 : 71 539 042–71 539 078, 37 basesExon 28 : 71 539 557–71 539 649, 93 basesExon 29 : 71 541 454–71 541 682, 229 basesExon 30 : 71 542 105–71 542 265, 161 basesExon 31 : 71 544 357–71 544 507, 151 basesExon 32 : 71 545 039–71 545 219, 181 basesExon 33 : 71 548 682–71 548 745, 64 basesExon 34 : 71 549 420–71 549 606, 187 basesExon 35 : 71 553 116–71 553 320, 205 basesExon 36 : 71 556 886–71 556 925, 40 basesExon 37 : 71 559 982–71 560 237, 256 basesExon 38 : 71 562 274–71 562 520, 247 basesExon 39 : 71 564 754–71 567 820, 3 067 bases15101520253035395′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 11 kb sur les 112,2 kb du gène ; 7 875 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit BDP1

2

positions dans BDP1 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 112,2 kb de BDP1, introns compris, et pas seulement les 11 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène BDP1 : BDP1 general transcription factor IIIB subunit. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/bdp1

Vancouver

Dante Labs. Gène BDP1 : BDP1 general transcription factor IIIB subunit [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/bdp1

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