Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

PPARGC1A

PPARG coactivator 1 alpha

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
4p15.2
Koordinaatit
Kromosomi 4: 23 792 021–23 890 047 (GRCh38)
Eksonit
13 eksonia 98 kb:n alueella
Proteiini
798 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
PGC1, PGC1A, PGC-1alpha, PPARAGCIα
Aiemmat symbolit
PPARGC1
MANE Select -transkripti
ENST00000264867.7NM_013261.5
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Ominaisuusraportti, jossa luetaan PPARGC1A

PPARGC1A-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 4, jossa hakasulke osoittaa PPARGC1A-geenin sijainnin. PPARGC1A ja 0 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 4, välillä 23 341 034–24 341 033.Kromosomi 44p15.2p16.3p16.2p16.1p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14p13p12p11q11q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.21q21.22q21.23q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26q27q28.1q28.2q28.3q31.1q31.21q31.22q31.23q31.3q32.1q32.2q32.3q33q34.1q34.2q34.3q35.1q35.223,4 Mb23,6 Mb23,8 Mb24 Mb24,2 MbPPARGC1A: 23 792 021–23 890 047, juoste taaksepäinPPARGC1APPARGC1A-kaavio: 13 eksonia kromosomin 4 juosteella, taaksepäinEkson 13: 23 792 021–23 795 925, 3 905 emästäEkson 12: 23 801 730–23 801 881, 152 emästäEkson 11: 23 802 224–23 802 345, 122 emästäEkson 10: 23 812 747–23 812 867, 121 emästäEkson 9: 23 813 021–23 813 125, 105 emästäEkson 8: 23 813 690–23 814 605, 916 emästäEkson 7: 23 824 280–23 824 353, 74 emästäEkson 6: 23 824 463–23 824 508, 46 emästäEkson 5: 23 828 400–23 828 604, 205 emästäEkson 4: 23 829 463–23 829 585, 123 emästäEkson 3: 23 831 557–23 831 751, 195 emästäEkson 2: 23 884 752–23 884 931, 180 emästäEkson 1: 23 889 904–23 890 047, 144 emästä1310515′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 6,3 kb geenin 98 kb:stä; 2 397 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

PPARGC1A-geenin sekvensointi

3Helppo

Kuinka vaikea PPARGC1A-geeni on sekvensoida lyhyillä lukemilla, asteikolla 0–100

Lähes kaikki PPARGC1A-geenin eksonit sijaitsevat kohdissa, joihin lyhyet lukemat kohdistuvat selvästi.

Tähän vaikuttaa myös se, kuinka suuri osa PPARGC1A-geenin eksoneista on kussakin vaikeassa aluetyypissä.

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Yhteinen chrY:n kanssa0 %
  • Referenssin kattavuus0 %
  • Toistot6,2 %
  • GC-pitoisuus7,5 %

Dante Labsin oma pisteytys omasta tutkimuksestamme, joka perustuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoituvista alueista.Näin pisteet lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). PPARGC1A-geeni: PPARG coactivator 1 alpha. Haettu 19. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/ppargc1a

Vancouver

Dante Labs. PPARGC1A-geeni: PPARG coactivator 1 alpha [Internet]. [viitattu 19. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/ppargc1a

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test