Hopp til innhold
Bruk midlene fra HSA eller FSA
Sekvenser genomet ditt (åpnes i en ny fane)

Gen

PPARGC1A

PPARG coactivator 1 alpha

Sammendrag

Cytogenetisk plassering
4p15.2
Koordinater
Kromosom 4: 23 792 021–23 890 047 (GRCh38)
Eksoner
13 eksoner over 98 kb
Protein
798 aminosyrer
Også kjent som
PGC1, PGC1A, PGC-1alpha, PPARAGCIα
Tidligere symboler
PPARGC1
MANE Select-transkripsjon
ENST00000264867.7NM_013261.5
Lokustype
Proteinkodende
  • Svært høy
  • Sikker
  • Lav
  • Svært lav

Egenskapsrapport som avleses i PPARGC1A

Slik er PPARGC1A bygget opp

  • Kodende sekvens
  • Utranslatert region
  • Intron
  • Transkripsjonsretning
  • Områder som korte avlesninger sliter med
Kromosom 4, med en parentes der PPARGC1A står. PPARGC1A og 0 gener i nærheten på kromosom 4, fra 23 341 034 til 24 341 033.Kromosom 44p15.2p16.3p16.2p16.1p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14p13p12p11q11q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.21q21.22q21.23q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26q27q28.1q28.2q28.3q31.1q31.21q31.22q31.23q31.3q32.1q32.2q32.3q33q34.1q34.2q34.3q35.1q35.223,4 Mb23,6 Mb23,8 Mb24 Mb24,2 MbPPARGC1A: 23 792 021–23 890 047, bakover-strengPPARGC1ADiagram av PPARGC1A: 13 eksoner på bakover-strengen til kromosom 4Ekson 13: 23 792 021–23 795 925, 3 905 baserEkson 12: 23 801 730–23 801 881, 152 baserEkson 11: 23 802 224–23 802 345, 122 baserEkson 10: 23 812 747–23 812 867, 121 baserEkson 9: 23 813 021–23 813 125, 105 baserEkson 8: 23 813 690–23 814 605, 916 baserEkson 7: 23 824 280–23 824 353, 74 baserEkson 6: 23 824 463–23 824 508, 46 baserEkson 5: 23 828 400–23 828 604, 205 baserEkson 4: 23 829 463–23 829 585, 123 baserEkson 3: 23 831 557–23 831 751, 195 baserEkson 2: 23 884 752–23 884 931, 180 baserEkson 1: 23 889 904–23 890 047, 144 baser1310515′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.

Eksonene utgjør 6,3 kb av genets 98 kb, og 2 397 av disse basene koder for proteinet.

Sekvensering av PPARGC1A

3Lett

Hvor vanskelig PPARGC1A er å sekvensere med korte leser, av 100

Nesten alle eksonene til PPARGC1A ligger der korte leser kan kartlegges uten problemer.

Det som kommer i tillegg: andelen av eksonene til PPARGC1A i hver type vanskelig område

  • Kartleggbarhet0 %
  • Homologi0 %
  • Delt med chrY0 %
  • Referansedekning0 %
  • Repetisjoner6,2 %
  • GC-innhold7,5 %

En Dante Labs-poengsum basert på egen forskning, bygget på NISTs Genome in a Bottle-kart over vanskelig sekvenserbare områder.Slik beregnes poengsummen

Eksterne lenker

Her kommer dette fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
  • Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.

Siter denne siden

APA

Dante Labs. (u.d.). PPARGC1A-genet: PPARG coactivator 1 alpha. Hentet 19. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/ppargc1a

Vancouver

Dante Labs. PPARGC1A-genet: PPARG coactivator 1 alpha [Internett]. [sitert 19. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/ppargc1a

Én test. En livstid med svar.

Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker

Få mitt Genome Test