Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

PPARGC1A

PPARG coactivator 1 alpha

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
4p15.2
Koordináták
4. kromoszóma: 23 792 021–23 890 047 (GRCh38)
Exonok
13 exon, összesen 98 kb
Fehérje
798 aminosav
Más néven ismert
PGC1, PGC1A, PGC-1alpha, PPARAGCIα
Korábbi jelölések
PPARGC1
MANE Select transzkriptum
ENST00000264867.7NM_013261.5
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

A PPARGC1A génre vonatkozó tulajdonságjelentés

A PPARGC1A felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
4. kromoszóma, a PPARGC1A helyét zárójel jelöli. A PPARGC1A és környékén 0 gén a 4. kromoszómán, 23 341 034–24 341 033 között.4. kromoszóma4p15.2p16.3p16.2p16.1p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14p13p12p11q11q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.21q21.22q21.23q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26q27q28.1q28.2q28.3q31.1q31.21q31.22q31.23q31.3q32.1q32.2q32.3q33q34.1q34.2q34.3q35.1q35.223,4 Mb23,6 Mb23,8 Mb24 Mb24,2 MbPPARGC1A: 23 792 021–23 890 047, fordított szálPPARGC1AA PPARGC1A ábrája: 13 exon a(z) 4. kromoszóma fordított szálán13. exon: 23 792 021–23 795 925, 3905 bázis12. exon: 23 801 730–23 801 881, 152 bázis11. exon: 23 802 224–23 802 345, 122 bázis10. exon: 23 812 747–23 812 867, 121 bázis9. exon: 23 813 021–23 813 125, 105 bázis8. exon: 23 813 690–23 814 605, 916 bázis7. exon: 23 824 280–23 824 353, 74 bázis6. exon: 23 824 463–23 824 508, 46 bázis5. exon: 23 828 400–23 828 604, 205 bázis4. exon: 23 829 463–23 829 585, 123 bázis3. exon: 23 831 557–23 831 751, 195 bázis2. exon: 23 884 752–23 884 931, 180 bázis1. exon: 23 889 904–23 890 047, 144 bázis1310515′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 98 kb-jából 6,3 kb-ot tesznek ki; ezek közül 2397 bázis kódolja a fehérjét.

PPARGC1A szekvenálása

3Könnyű

Mennyire nehéz a PPARGC1A rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A PPARGC1A exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a PPARGC1A exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség0%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések6,2%
  • GC-tartalom7,5%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). PPARGC1A gén: PPARG coactivator 1 alpha. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/ppargc1a

Vancouver

Dante Labs. PPARGC1A gén: PPARG coactivator 1 alpha [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/ppargc1a

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet