Przejdź do treści
Skorzystaj ze środków HSA lub FSA
Zsekwencjonuj swój genom (otwiera się w nowej karcie)

Gen

PPARGC1A

PPARG coactivator 1 alpha

Podsumowanie

Lokalizacja cytogenetyczna
4p15.2
Współrzędne
Chromosom 4: 23 792 021–23 890 047 (GRCh38)
Eksony
13 eksonów na odcinku 98 kb
Białko
798 aminokwasów
Znany również jako
PGC1, PGC1A, PGC-1alpha, PPARAGCIα
Poprzednie symbole
PPARGC1
Transkrypt MANE Select
ENST00000264867.7NM_013261.5
Typ locus
Kodujące białko
  • Bardzo wysoka
  • Pewna
  • Niska
  • Bardzo niska

Raport o cesze, w którym odczytano PPARGC1A

Budowa genu PPARGC1A

  • Sekwencja kodująca
  • Region nieulegający translacji
  • Intron
  • Kierunek transkrypcji
  • Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Chromosom 4, z nawiasem wskazującym położenie PPARGC1A. PPARGC1A i 0 genów w pobliżu na chromosomie 4, od 23 341 034 do 24 341 033.Chromosom 44p15.2p16.3p16.2p16.1p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14p13p12p11q11q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.21q21.22q21.23q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26q27q28.1q28.2q28.3q31.1q31.21q31.22q31.23q31.3q32.1q32.2q32.3q33q34.1q34.2q34.3q35.1q35.223,4 Mb23,6 Mb23,8 Mb24 Mb24,2 MbPPARGC1A: 23 792 021–23 890 047, nić ujemnejPPARGC1ASchemat PPARGC1A: 13 eksonów na nici ujemnej chromosomu 4Ekson 13: 23 792 021–23 795 925, 3905 zasadEkson 12: 23 801 730–23 801 881, 152 zasadEkson 11: 23 802 224–23 802 345, 122 zasadEkson 10: 23 812 747–23 812 867, 121 zasadEkson 9: 23 813 021–23 813 125, 105 zasadEkson 8: 23 813 690–23 814 605, 916 zasadEkson 7: 23 824 280–23 824 353, 74 zasadEkson 6: 23 824 463–23 824 508, 46 zasadEkson 5: 23 828 400–23 828 604, 205 zasadEkson 4: 23 829 463–23 829 585, 123 zasadEkson 3: 23 831 557–23 831 751, 195 zasadEkson 2: 23 884 752–23 884 931, 180 zasadEkson 1: 23 889 904–23 890 047, 144 zasad1310515′3′

Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.

Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.

Eksony stanowią 6,3 kb z 98 kb genu; 2397 z tych zasad kodują białko.

Sekwencjonowanie PPARGC1A

3Łatwo

Jak trudno zsekwencjonować PPARGC1A krótkimi odczytami, w skali do 100

Niemal wszystkie eksony PPARGC1A znajdują się w miejscach, które krótkie odczyty mapują bez problemu.

Co na to wpływa: udział eksonów PPARGC1A w każdym rodzaju trudnego regionu

  • Mapowalność0%
  • Homologia0%
  • Wspólne z chrY0%
  • Pokrycie sekwencji referencyjnej0%
  • Powtórzenia6,2%
  • Zawartość GC7,5%

Wynik Dante Labs z naszych własnych badań, oparty na mapach trudnych do zsekwencjonowania regionów Genome in a Bottle z NIST.Jak obliczany jest wynik

Linki zewnętrzne

Skąd to pochodzi

  • HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
  • MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
  • Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.

Cytuj tę stronę

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen PPARGC1A: PPARG coactivator 1 alpha. Pobrano 19 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/ppargc1a

Vancouver

Dante Labs. Gen PPARGC1A: PPARG coactivator 1 alpha [Internet]. [cytowano 19 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/ppargc1a

Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.

Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni

Zamawiam Genome Test