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Gen

PPARGC1A

PPARG coactivator 1 alpha

Zusammenfassung

Zytogenetische Lage
4p15.2
Koordinaten
Chromosom 4: 23.792.021–23.890.047 (GRCh38)
Exons
13 Exons über 98 kb
Protein
798 Aminosäuren
Auch bekannt als
PGC1, PGC1A, PGC-1alpha, PPARAGCIα
Frühere Symbole
PPARGC1
MANE-Select-Transkript
ENST00000264867.7NM_013261.5
Locus-Typ
Proteinkodierend
  • Sehr hoch
  • Zuversichtlich
  • Niedrig
  • Sehr niedrig

Merkmalsbericht, der PPARGC1A auswertet

Aufbau von PPARGC1A

  • Kodierende Sequenz
  • Nicht translatierte Region
  • Intron
  • Transkriptionsrichtung
  • Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen
Chromosom 4, mit einer Klammer, an der PPARGC1A liegt. PPARGC1A und 0 Gene in der Nähe auf Chromosom 4, von 23.341.034 bis 24.341.033.Chromosom 44p15.2p16.3p16.2p16.1p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14p13p12p11q11q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.21q21.22q21.23q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26q27q28.1q28.2q28.3q31.1q31.21q31.22q31.23q31.3q32.1q32.2q32.3q33q34.1q34.2q34.3q35.1q35.223,4 Mb23,6 Mb23,8 Mb24 Mb24,2 MbPPARGC1A: 23.792.021–23.890.047, Minus-StrangPPARGC1ADiagramm von PPARGC1A: 13 Exons auf dem Minus-Strang von Chromosom 4Exon 13: 23.792.021–23.795.925, 3.905 BasenExon 12: 23.801.730–23.801.881, 152 BasenExon 11: 23.802.224–23.802.345, 122 BasenExon 10: 23.812.747–23.812.867, 121 BasenExon 9: 23.813.021–23.813.125, 105 BasenExon 8: 23.813.690–23.814.605, 916 BasenExon 7: 23.824.280–23.824.353, 74 BasenExon 6: 23.824.463–23.824.508, 46 BasenExon 5: 23.828.400–23.828.604, 205 BasenExon 4: 23.829.463–23.829.585, 123 BasenExon 3: 23.831.557–23.831.751, 195 BasenExon 2: 23.884.752–23.884.931, 180 BasenExon 1: 23.889.904–23.890.047, 144 Basen1310515′3′

Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.

Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).

Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.

Exons machen 6,3 kb der 98 kb des Gens aus; 2.397 dieser Basen kodieren für das Protein.

Sequenzierung von PPARGC1A

3Leicht

Wie schwer sich PPARGC1A mit Short Reads sequenzieren lässt, auf einer Skala von 100

Nahezu alle Exons von PPARGC1A liegen in Bereichen, in denen Short Reads sauber zugeordnet werden können.

Was hinzukommt: der Anteil der Exons von PPARGC1A in jeder Art schwieriger Region

  • Mappability0 %
  • Homologie0 %
  • Gemeinsam mit chrY0 %
  • Abdeckung der Referenz0 %
  • Wiederholungen6,2 %
  • GC-Gehalt7,5 %

Ein Score von Dante Labs aus eigener Forschung, basierend auf den Karten schwer zu sequenzierender Regionen von NIST (Genome in a Bottle).So wird bewertet

Externe Links

Herkunft der Daten

  • HGNC: das Gensymbol, der Name, weitere Symbole und die Lage des Gens.
  • MANE Select v1.5 von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.
  • Die Genome-in-a-Bottle-Genomstratifizierungen des NIST: der Schwierigkeitswert der Sequenzierung.

Diese Seite zitieren

APA

Dante Labs. (o. J.). PPARGC1A-Gen: PPARG coactivator 1 alpha. Abgerufen am 19. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/ppargc1a

Vancouver

Dante Labs. PPARGC1A-Gen: PPARG coactivator 1 alpha [Internet]. [zitiert am 19. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/ppargc1a

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