Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

GARIN1B

golgi associated RAB2 interactor 1B

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
7q32.1
Koordinaatit
Kromosomi 7: 128 715 391–128 731 743 (GRCh38)
Eksonit
7 eksonia 16,4 kb:n alueella
Proteiini
342 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
NYD-SP18, GARI-L1
Aiemmat symbolit
FAM137A, FAM71F1
MANE Select -transkripti
ENST00000621392.5NM_001282788.3
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä GARIN1B. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

GARIN1B-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 7, jossa hakasulke osoittaa GARIN1B-geenin sijainnin. GARIN1B ja 18 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 7, välillä 128 223 567–129 223 566.Kromosomi 77q32.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p15.3p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.11q21.12q21.13q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q31.1q31.2q31.31q31.32q31.33q32.1q32.2q32.3q33q34q35q36.1q36.2q36.3128,4 Mb128,6 Mb128,8 Mb129 Mb129,2 MbLEP: 128 241 222–128 257 629, juoste eteenpäinLEPRBM28: 128 278 493–128 343 971, juoste taaksepäinRBM28PRRT4: 128 350 325–128 361 940, juoste taaksepäinPRRT4IMPDH1: 128 392 277–128 410 009, juoste taaksepäinIMPDH1HILPDA: 128 455 825–128 458 423, juoste eteenpäinHILPDAMETTL2B: 128 476 729–128 506 602, juoste eteenpäinMETTL2BGARIN1A: 128 671 693–128 687 877, juoste eteenpäinGARIN1AGARIN1B: 128 715 391–128 731 743, juoste eteenpäinGARIN1BCALU: 128 739 292–128 773 400, juoste eteenpäinCALUOPN1SW: 128 771 755–128 775 794, juoste taaksepäinOPN1SWCCDC136: 128 790 750–128 822 135, juoste eteenpäinCCDC136FLNC: 128 830 292–128 859 275, juoste eteenpäinFLNCKCP: 128 862 042–128 910 719, juoste taaksepäinKCPATP6V1F: 128 862 816–128 865 849, juoste eteenpäinATP6V1FSPMIP1: 128 866 330–128 872 047, juoste eteenpäinSPMIP1IRF5: 128 933 429–128 950 389, juoste eteenpäinIRF5TNPO3: 128 954 180–129 055 208, juoste taaksepäinTNPO3TSPAN33: 129 144 690–129 177 456, juoste eteenpäinTSPAN33SMO: 129 188 501–129 213 546, juoste eteenpäinSMOGARIN1B-kaavio: 7 eksonia kromosomin 7 juosteella, eteenpäinEkson 1: 128 715 391–128 715 690, 300 emästäEkson 2: 128 716 813–128 716 997, 185 emästäEkson 3: 128 718 831–128 719 083, 253 emästäEkson 4: 128 723 197–128 723 318, 122 emästäEkson 5: 128 726 834–128 726 871, 38 emästäEkson 6: 128 729 902–128 730 069, 168 emästäEkson 7: 128 731 100–128 731 743, 644 emästä12345675′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 1,7 kb geenin 16,4 kb:stä; 1 029 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

GARIN1B-geenin sekvensointi

1Helppo

Kuinka vaikea GARIN1B-geeni on sekvensoida lyhyillä luennoilla, asteikolla 0–100

Lähes kaikki GARIN1B-geenin eksonit sijaitsevat kohdissa, joissa lyhyet luennat kohdistuvat selvästi.

Lisäksi vaikuttaa se, kuinka suuri osa GARIN1B-geenin eksoneista sijaitsee kussakin vaikeassa alueessa.

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Shared with chrY0 %
  • Referenssin peittävyys0 %
  • Toistot4 %
  • GC-pitoisuus0 %

Dante Labsin oma pisteytys omasta tutkimuksestamme, joka perustuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoitavista alueista.Miten pisteet lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). GARIN1B-geeni: golgi associated RAB2 interactor 1B. Haettu 19. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/garin1b

Vancouver

Dante Labs. GARIN1B-geeni: golgi associated RAB2 interactor 1B [Internet]. [viitattu 19. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/garin1b

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test