Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

AURKAIP1

aurora kinase A interacting protein 1

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
1p36.33
Koordinaatit
Kromosomi 1: 1 373 736–1 375 207 (GRCh38)
Eksonit
4 eksonia 1,5 kb:n alueella
Proteiini
199 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
Cox24, AKIP, AIP, FLJ20608, mS38
MANE Select -transkripti
ENST00000338338.10NM_017900.3
Lokustyyppi
Proteiinia koodaava
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä AURKAIP1. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

AURKAIP1-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
Kromosomi 1, jossa hakasulke osoittaa AURKAIP1-geenin sijainnin. AURKAIP1 ja 43 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 1, välillä 874 472–1 874 471.Kromosomi 11p36.33p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q441 Mb1,2 Mb1,4 Mb1,6 Mb1,8 MbSAMD11: 923 895–944 590, juoste eteenpäinNOC2L: 943 527–960 714, juoste taaksepäinKLHL17: 960 555–965 721, juoste eteenpäinPLEKHN1: 966 437–975 865, juoste eteenpäinPLEKHN1PERM1: 975 194–982 137, juoste taaksepäinPERM1HES4: 998 962–1 000 825, juoste taaksepäinHES4ISG15: 1 001 138–1 014 540, juoste eteenpäinISG15AGRN: 1 020 069–1 056 119, juoste eteenpäinAGRNRNF223: 1 070 967–1 074 306, juoste taaksepäinRNF223C1orf159: 1 081 811–1 116 361, juoste taaksepäinC1orf159TTLL10: 1 173 880–1 197 940, juoste eteenpäinTNFRSF18: 1 203 508–1 206 814, juoste taaksepäinTNFRSF4: 1 211 326–1 214 153, juoste taaksepäinSDF4: 1 216 887–1 240 964, juoste taaksepäinSDF4B3GALT6: 1 232 237–1 235 041, juoste eteenpäinB3GALT6C1QTNF12: 1 242 446–1 246 934, juoste taaksepäinC1QTNF12UBE2J2: 1 253 907–1 274 477, juoste taaksepäinUBE2J2SCNN1D: 1 280 436–1 292 029, juoste eteenpäinSCNN1DACAP3: 1 292 376–1 309 609, juoste taaksepäinPUSL1: 1 308 547–1 311 679, juoste eteenpäinINTS11: 1 311 585–1 324 688, juoste taaksepäinCPTP: 1 324 756–1 328 897, juoste eteenpäinTAS1R3: 1 331 275–1 335 314, juoste eteenpäinTAS1R3DVL1: 1 335 275–1 349 962, juoste taaksepäinDVL1MXRA8: 1 352 683–1 361 800, juoste taaksepäinMXRA8AURKAIP1: 1 373 736–1 375 207, juoste taaksepäinAURKAIP1CCNL2: 1 385 709–1 400 909, juoste taaksepäinCCNL2MRPL20: 1 401 907–1 407 306, juoste taaksepäinMRPL20ANKRD65: 1 415 637–1 421 769, juoste taaksepäinANKRD65TMEM278: 1 425 871–1 430 255, juoste eteenpäinVWA1: 1 434 861–1 446 012, juoste eteenpäinATAD3C: 1 449 689–1 470 163, juoste eteenpäinATAD3CATAD3B: 1 471 742–1 497 848, juoste eteenpäinATAD3BATAD3A: 1 512 118–1 534 689, juoste eteenpäinATAD3ATMEM240: 1 534 778–1 540 624, juoste taaksepäinTMEM240SSU72: 1 541 673–1 574 887, juoste taaksepäinSSU72FNDC10: 1 598 012–1 600 135, juoste taaksepäinFNDC10MIB2: 1 615 433–1 630 610, juoste eteenpäinMIB2MMP23B: 1 631 660–1 635 263, juoste eteenpäinMMP23BCDK11B: 1 635 225–1 659 267, juoste taaksepäinCDK11BSLC35E2B: 1 659 529–1 693 059, juoste taaksepäinSLC35E2BCDK11A: 1 702 379–1 724 571, juoste taaksepäinCDK11ANADK: 1 751 232–1 780 544, juoste taaksepäinNADKGNB1: 1 785 285–1 892 292, juoste taaksepäinGNB1AURKAIP1-kaavio: 4 eksonia kromosomin 1 juosteella, taaksepäinEkson 4: 1 373 736–1 373 902, 167 emästäEkson 3: 1 374 000–1 374 445, 446 emästäEkson 2: 1 374 705–1 374 790, 86 emästäEkson 1: 1 375 154–1 375 207, 54 emästä43215′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 0,8 kb geenin 1,5 kb:stä; 600 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

AURKAIP1-geenin sekvensointi

7Helppo

Kuinka vaikea AURKAIP1-geeni on sekvensoida lyhyillä luennoilla, asteikolla 0–100

Lähes kaikki AURKAIP1-geenin eksonit sijaitsevat kohdissa, joissa lyhyet luennat kohdistuvat selvästi.

Lisäksi vaikuttaa se, kuinka suuri osa AURKAIP1-geenin eksoneista sijaitsee kussakin vaikeassa alueessa.

  • Kartoitettavuus0 %
  • Homologia0 %
  • Toistot0 %
  • GC-pitoisuus67 %
  • Referenssin peittävyys0 %

Dante Labsin oma pisteytys omasta tutkimuksestamme, joka perustuu NISTin Genome in a Bottle -karttoihin vaikeasti sekvensoitavista alueista.Miten pisteet lasketaan

Ulkoiset linkit

Mistä tiedot ovat peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). AURKAIP1-geeni: aurora kinase A interacting protein 1. Haettu 18. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/aurkaip1

Vancouver

Dante Labs. AURKAIP1-geeni: aurora kinase A interacting protein 1 [Internet]. [viitattu 18. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/aurkaip1

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test