Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

VAX1

ventral anterior homeobox 1

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
10q25.3
Koordinaadid
Kromosoom 10: 117 133 290–117 138 270 (GRCh38)
Eksonid
3 eksonit, ulatus 5 kb
Valk
334 aminohapet
MANE Select transkript
ENST00000369206.6NM_001112704.2
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni VAX1 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas VAX1 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
Kromosoom 10, millel on sulg kohal, kus asub VAX1. VAX1 ja sellele lähedal asuvad 9 geeni kromosoomil 10, vahemikus 116 635 780 kuni 117 635 779.Kromosoom 1010q25.3p15.3p15.2p15.1p14p13p12.33p12.32p12.31p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.21q11.22q11.23q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.31q23.32q23.33q24.1q24.2q24.31q24.32q24.33q25.1q25.2q25.3q26.11q26.12q26.13q26.2q26.3116,8 Mb117 Mb117,2 Mb117,4 Mb117,6 MbPNLIPRP2: 116 620 953–116 645 143, otsene ahelPNLIPRP2SPMIP5: 116 662 208–116 670 312, pöördne ahelSPMIP5HSPA12A: 116 671 192–116 850 251, pöördne ahelHSPA12AENO4: 116 849 481–116 911 788, otsene ahelENO4SHTN1: 116 881 477–117 126 586, pöördne ahelSHTN1VAX1: 117 133 290–117 138 270, pöördne ahelVAX1KCNK18: 117 196 957–117 210 752, otsene ahelKCNK18SLC18A2: 117 240 830–117 279 431, otsene ahelSLC18A2PDZD8: 117 277 274–117 376 020, pöördne ahelPDZD8EMX2: 117 542 445–117 549 546, otsene ahelEMX2VAX1 skeem: 3 eksonit kromosoomi 10 pöördne ahelalEkson 1: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 3: 117 133 290–117 134 583, 1294 alustEkson 2: 117 136 472–117 136 659, 188 alustEkson 1: 117 137 816–117 138 270, 455 alust3215′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 1,9 kb kogupikkusega 5 kb; neist 1005 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse VAX1

1

koht geenis VAX1, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni VAX1 5 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (1,9 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). VAX1 geen: ventral anterior homeobox 1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/vax1

Vancouver

Dante Labs. VAX1 geen: ventral anterior homeobox 1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/vax1

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test