Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

SPATC1L

spermatogenesis and centriole associated 1 like

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
21q22.3
Koordinaadid
Kromosoom 21: 46 161 160–46 184 459 (GRCh38)
Eksonid
5 eksonit, ulatus 23,3 kb
Valk
340 aminohapet
Varasemad tähised
C21orf56
MANE Select transkript
ENST00000291672.6NM_001142854.2
Lookuse tüüp
Valke kodeeriv
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni SPATC1L veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas SPATC1L on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 21, millel on sulg kohal, kus asub SPATC1L. SPATC1L ja sellele lähedal asuvad 13 geeni kromosoomil 21, vahemikus 45 672 810 kuni 46 672 809.Kromosoom 2121q22.3p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q21.1q21.2q21.3q22.11q22.12q22.13q22.2q22.345,8 Mb46 Mb46,2 Mb46,4 Mb46,6 MbPCBP3: 45 643 661–45 942 454, otsene ahelPCBP3COL6A1: 45 981 727–46 005 050, otsene ahelCOL6A1COL6A2: 46 096 722–46 132 851, otsene ahelCOL6A2FTCD: 46 136 082–46 156 047, pöördne ahelFTCDSPATC1L: 46 161 160–46 184 459, pöördne ahelSPATC1LLSS: 46 187 299–46 228 840, pöördne ahelLSSMCM3AP: 46 232 689–46 286 617, pöördne ahelMCM3APYBEY: 46 285 831–46 313 301, otsene ahelYBEYC21orf58: 46 291 929–46 324 470, pöördne ahelC21orf58PCNT: 46 324 082–46 445 769, otsene ahelPCNT: 46 326 288–46 326 491, otsene ahelDIP2A: 46 458 841–46 572 746, otsene ahelDIP2AS100B: 46 598 355–46 605 208, pöördne ahelS100BPRMT2: 46 635 197–46 666 229, otsene ahelPRMT2SPATC1L skeem: 5 eksonit kromosoomi 21 pöördne ahelalEkson 5: 46 161 160–46 161 705, 546 alustEkson 4: 46 161 916–46 162 067, 152 alustEkson 3: 46 168 308–46 168 658, 351 alustEkson 2: 46 182 624–46 183 774, 1151 alustEkson 1: 46 184 356–46 184 459, 104 alust543215′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 2,3 kb kogupikkusega 23,3 kb; neist 1023 alust kodeerivad valku.

Sekveneerimine: SPATC1L

31Mõõdukas

Kui raske on geeni SPATC1L lühikeste lugemitega järjestada, skaalal 0–100

Osa geeni SPATC1L eksonitest asub kohtades, kus lühikesed lugemid võivad muutuse vahele jätta või valesti paigutada.

Lisaks mõjutab tulemust see, kui suur osa geeni SPATC1L eksonitest asub igat tüüpi rasketes piirkondades

  • Kaardistatavus12%
  • Homoloogia0%
  • Ühine chrY-ga0%
  • Viitekatvus0%
  • Kordused17%
  • GC-sisaldus84%

Dante Labsi skoor, mis põhineb meie enda uuringul ja NISTi Genome in a Bottle kaartidel raskesti järjestatavate piirkondade kohta.Kuidas skoor arvutatakse

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). SPATC1L geen: spermatogenesis and centriole associated 1 like. Vaadatud 19. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/spatc1l

Vancouver

Dante Labs. SPATC1L geen: spermatogenesis and centriole associated 1 like [Internet]. [viidatud 19. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/spatc1l

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test