Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

PHAF1

phagophore assembly factor 1

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
16q22.1
Koordinaadid
Kromosoom 16: 67 109 941–67 148 544 (GRCh38)
Eksonid
16 eksonit, ulatus 38,6 kb
Valk
422 aminohapet
Tuntud ka kui
lin-10, FLJ12076, MYTHO
Varasemad tähised
C16orf6, LIN10, C16orf70
MANE Select transkript
ENST00000219139.8NM_025187.5
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni PHAF1 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas PHAF1 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 16, millel on sulg kohal, kus asub PHAF1. PHAF1 ja sellele lähedal asuvad 36 geeni kromosoomil 16, vahemikus 66 629 243 kuni 67 629 242.Kromosoom 1616q22.1p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.366,8 Mb67 Mb67,2 Mb67,4 Mb67,6 MbCMTM4: 66 614 750–66 696 856, pöördne ahelCMTM4DYNC1LI2: 66 720 893–66 751 856, pöördne ahelDYNC1LI2TERB1: 66 754 640–66 801 620, pöördne ahelTERB1NAE1: 66 802 874–66 873 256, pöördne ahelNAE1CA7: 66 844 414–66 854 153, otsene ahelCA7PDP2: 66 878 589–66 895 754, otsene ahelPDP2CDH16: 66 908 122–66 919 187, pöördne ahelCDH16RRAD: 66 921 682–66 926 308, pöördne ahelRRADCIAO2B: 66 931 938–66 934 929, pöördne ahelCIAO2BCES2: 66 934 433–66 945 096, otsene ahelCES2CES3: 66 961 219–66 975 162, otsene ahelCES3CES4A: 66 988 574–67 010 417, otsene ahelCES4ACBFB: 67 028 984–67 101 058, otsene ahelCBFBPHAF1: 67 109 941–67 148 544, otsene ahelPHAF1B3GNT9: 67 142 023–67 151 260, pöördne ahelB3GNT9TRADD: 67 153 969–67 163 760, pöördne ahelTRADDFBXL8: 67 159 932–67 164 570, otsene ahelFBXL8: 67 163 385–67 165 815, otsene ahelHSF4: 67 164 681–67 169 945, otsene ahelNOL3: 67 170 154–67 176 189, otsene ahelMATCAP1: 67 175 599–67 184 228, pöördne ahelEXOC3L1: 67 184 313–67 190 242, pöördne ahelE2F4: 67 192 117–67 198 919, otsene ahelELMO3: 67 199 105–67 204 029, otsene ahelTMEM208: 67 227 103–67 229 281, otsene ahelTMEM208FHOD1: 67 229 387–67 247 539, pöördne ahelFHOD1SLC9A5: 67 237 683–67 272 191, otsene ahelSLC9A5PLEKHG4: 67 277 510–67 289 499, otsene ahelPLEKHG4KCTD19: 67 289 428–67 326 766, pöördne ahelKCTD19LRRC36: 67 326 798–67 385 221, otsene ahelLRRC36TPPP3: 67 389 027–67 393 518, pöördne ahelTPPP3ZDHHC1: 67 394 152–67 416 833, pöördne ahelZDHHC1HSD11B2: 67 430 652–67 437 553, otsene ahelHSD11B2ATP6V0D1: 67 437 523–67 481 227, pöördne ahelATP6V0D1AGRP: 67 482 571–67 483 552, pöördne ahelAGRPRIPOR1: 67 518 418–67 546 788, otsene ahelRIPOR1CTCF: 67 561 831–67 639 189, otsene ahelCTCFPHAF1 skeem: 16 eksonit kromosoomi 16 otsene ahelalEkson 1: 67 109 941–67 110 239, 299 alustEkson 2: 67 120 112–67 120 194, 83 alustEkson 3: 67 125 959–67 126 042, 84 alustEkson 4: 67 131 286–67 131 329, 44 alustEkson 5: 67 132 446–67 132 525, 80 alustEkson 6: 67 132 817–67 132 911, 95 alustEkson 7: 67 134 168–67 134 265, 98 alustEkson 8: 67 134 355–67 134 467, 113 alustEkson 9: 67 139 984–67 140 117, 134 alustEkson 10: 67 140 511–67 140 594, 84 alustEkson 11: 67 144 294–67 144 376, 83 alustEkson 12: 67 144 834–67 144 877, 44 alustEkson 13: 67 145 376–67 145 419, 44 alustEkson 14: 67 145 570–67 145 628, 59 alustEkson 15: 67 146 278–67 146 350, 73 alustEkson 16: 67 147 045–67 148 544, 1500 alust151015165′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 2,9 kb kogupikkusega 38,6 kb; neist 1269 alust kodeerivad valku.

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). PHAF1 geen: phagophore assembly factor 1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/phaf1

Vancouver

Dante Labs. PHAF1 geen: phagophore assembly factor 1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/phaf1

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test