Przejdź do treści
Skorzystaj ze środków HSA lub FSA

Gen

PHAF1

phagophore assembly factor 1

Podsumowanie

Lokalizacja cytogenetyczna
16q22.1
Współrzędne
Chromosom 16: 67 109 941–67 148 544 (GRCh38)
Eksony
16 eksonów na odcinku 38,6 kb
Białko
422 aminokwasów
Znany również jako
lin-10, FLJ12076, MYTHO
Poprzednie symbole
C16orf6, LIN10, C16orf70
Transkrypt MANE Select
ENST00000219139.8NM_025187.5
Typ locus
gene with protein product
  • Bardzo wysoka
  • Pewna
  • Niska
  • Bardzo niska

Genom referencyjnyGRCh38

Pozycje na stronach genów i wariantów zależą od tego wyboru, w tej przeglądarce.

Wyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu

Żaden raport Genome Test jeszcze nie odczytuje genu PHAF1. Test sekwencjonuje cały genom, więc dane obejmują go mimo to.

Budowa genu PHAF1

  • Sekwencja kodująca
  • Region nieulegający translacji
  • Intron
  • Kierunek transkrypcji
  • Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Chromosom 16, z nawiasem wskazującym położenie PHAF1. PHAF1 i 36 genów w pobliżu na chromosomie 16, od 66 629 243 do 67 629 242.Chromosom 1616q22.1p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.366,8 Mb67 Mb67,2 Mb67,4 Mb67,6 MbCMTM4: 66 614 750–66 696 856, nić ujemnejCMTM4DYNC1LI2: 66 720 893–66 751 856, nić ujemnejDYNC1LI2TERB1: 66 754 640–66 801 620, nić ujemnejTERB1NAE1: 66 802 874–66 873 256, nić ujemnejNAE1CA7: 66 844 414–66 854 153, nić dodatniejCA7PDP2: 66 878 589–66 895 754, nić dodatniejPDP2CDH16: 66 908 122–66 919 187, nić ujemnejCDH16RRAD: 66 921 682–66 926 308, nić ujemnejRRADCIAO2B: 66 931 938–66 934 929, nić ujemnejCIAO2BCES2: 66 934 433–66 945 096, nić dodatniejCES2CES3: 66 961 219–66 975 162, nić dodatniejCES3CES4A: 66 988 574–67 010 417, nić dodatniejCES4ACBFB: 67 028 984–67 101 058, nić dodatniejCBFBPHAF1: 67 109 941–67 148 544, nić dodatniejPHAF1B3GNT9: 67 142 023–67 151 260, nić ujemnejB3GNT9TRADD: 67 153 969–67 163 760, nić ujemnejTRADDFBXL8: 67 159 932–67 164 570, nić dodatniejFBXL8: 67 163 385–67 165 815, nić dodatniejHSF4: 67 164 681–67 169 945, nić dodatniejNOL3: 67 170 154–67 176 189, nić dodatniejMATCAP1: 67 175 599–67 184 228, nić ujemnejEXOC3L1: 67 184 313–67 190 242, nić ujemnejE2F4: 67 192 117–67 198 919, nić dodatniejELMO3: 67 199 105–67 204 029, nić dodatniejTMEM208: 67 227 103–67 229 281, nić dodatniejTMEM208FHOD1: 67 229 387–67 247 539, nić ujemnejFHOD1SLC9A5: 67 237 683–67 272 191, nić dodatniejSLC9A5PLEKHG4: 67 277 510–67 289 499, nić dodatniejPLEKHG4KCTD19: 67 289 428–67 326 766, nić ujemnejKCTD19LRRC36: 67 326 798–67 385 221, nić dodatniejLRRC36TPPP3: 67 389 027–67 393 518, nić ujemnejTPPP3ZDHHC1: 67 394 152–67 416 833, nić ujemnejZDHHC1HSD11B2: 67 430 652–67 437 553, nić dodatniejHSD11B2ATP6V0D1: 67 437 523–67 481 227, nić ujemnejATP6V0D1AGRP: 67 482 571–67 483 552, nić ujemnejAGRPRIPOR1: 67 518 418–67 546 788, nić dodatniejRIPOR1CTCF: 67 561 831–67 639 189, nić dodatniejCTCFSchemat PHAF1: 16 eksonów na nici dodatniej chromosomu 16Ekson 1: 67 109 941–67 110 239, 299 zasadEkson 2: 67 120 112–67 120 194, 83 zasadEkson 3: 67 125 959–67 126 042, 84 zasadEkson 4: 67 131 286–67 131 329, 44 zasadEkson 5: 67 132 446–67 132 525, 80 zasadEkson 6: 67 132 817–67 132 911, 95 zasadEkson 7: 67 134 168–67 134 265, 98 zasadEkson 8: 67 134 355–67 134 467, 113 zasadEkson 9: 67 139 984–67 140 117, 134 zasadEkson 10: 67 140 511–67 140 594, 84 zasadEkson 11: 67 144 294–67 144 376, 83 zasadEkson 12: 67 144 834–67 144 877, 44 zasadEkson 13: 67 145 376–67 145 419, 44 zasadEkson 14: 67 145 570–67 145 628, 59 zasadEkson 15: 67 146 278–67 146 350, 73 zasadEkson 16: 67 147 045–67 148 544, 1500 zasad151015165′3′

Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.

Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.

Eksony stanowią 2,9 kb z 38,6 kb genu; 1269 z tych zasad kodują białko.

Skąd pochodzą te dane

  • HGNC: symbol genu, jego nazwa, inne symbole i położenie.
  • MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.

Cytuj tę stronę

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen PHAF1: phagophore assembly factor 1. Pobrano 17 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/phaf1

Vancouver

Dante Labs. Gen PHAF1: phagophore assembly factor 1 [Internet]. [cytowano 17 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/phaf1

Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.

Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni

Zamawiam Genome Test