Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

HDC

histidine decarboxylase

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
15q21.2
Koordinaadid
Kromosoom 15: 50 241 947–50 265 726 (GRCh38)
Eksonid
12 eksonit, ulatus 23,8 kb
Valk
662 aminohapet
MANE Select transkript
ENST00000267845.8NM_002112.4
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni HDC veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas HDC on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 15, millel on sulg kohal, kus asub HDC. HDC ja sellele lähedal asuvad 8 geeni kromosoomil 15, vahemikus 49 753 837 kuni 50 753 836.Kromosoom 1515q21.2p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q14q15.1q15.2q15.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26.1q26.2q26.349,8 Mb50 Mb50,2 Mb50,4 Mb50,6 MbATP8B4: 49 858 238–50 182 947, pöördne ahelATP8B4SLC27A2: 50 182 196–50 236 450, otsene ahelSLC27A2HDC: 50 241 947–50 265 726, pöördne ahelHDCGABPB1: 50 275 389–50 355 440, pöördne ahelGABPB1USP8: 50 423 584–50 514 421, otsene ahelUSP8USP50: 50 494 018–50 546 708, pöördne ahelUSP50TRPM7: 50 552 473–50 686 845, pöördne ahelTRPM7: 50 648 802–50 686 717, pöördne ahelSPPL2A: 50 702 266–50 765 948, pöördne ahelSPPL2AHDC skeem: 12 eksonit kromosoomi 15 pöördne ahelalEkson 12: 50 241 947–50 243 006, 1060 alustEkson 11: 50 243 143–50 243 244, 102 alustEkson 10: 50 248 245–50 248 343, 99 alustEkson 9: 50 252 430–50 252 520, 91 alustEkson 8: 50 252 612–50 252 774, 163 alustEkson 7: 50 253 600–50 253 666, 67 alustEkson 6: 50 254 130–50 254 273, 144 alustEkson 5: 50 254 530–50 254 664, 135 alustEkson 4: 50 257 425–50 257 547, 123 alustEkson 3: 50 258 404–50 258 517, 114 alustEkson 2: 50 263 235–50 263 407, 173 alustEkson 1: 50 265 593–50 265 726, 134 alust1210864215′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 2,4 kb kogupikkusega 23,8 kb; neist 1989 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse HDC

2

kohad geenis HDC, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni HDC 23,8 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (2,4 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). HDC geen: histidine decarboxylase. Vaadatud 16. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/hdc

Vancouver

Dante Labs. HDC geen: histidine decarboxylase [Internet]. [viidatud 16. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/hdc

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test