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Gène

HDC

histidine decarboxylase

Résumé

Localisation cytogénétique
15q21.2
Coordonnées
Chromosome 15 : 50 241 947–50 265 726 (GRCh38)
Exons
12 exons sur 23,8 kb
Protéine
662 acides aminés
Transcrit MANE Select
ENST00000267845.8NM_002112.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore HDC. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de HDC

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 15, avec un crochet à l'emplacement de HDC. HDC et 8 gènes à proximité sur le chromosome 15, de 49 753 837 à 50 753 836.Chromosome 1515q21.2p13p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q14q15.1q15.2q15.3q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.31q22.32q22.33q23q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q26.1q26.2q26.349,8 Mb50 Mb50,2 Mb50,4 Mb50,6 MbATP8B4 : 49 858 238–50 182 947, brin inverseATP8B4SLC27A2 : 50 182 196–50 236 450, brin directSLC27A2HDC : 50 241 947–50 265 726, brin inverseHDCGABPB1 : 50 275 389–50 355 440, brin inverseGABPB1USP8 : 50 423 584–50 514 421, brin directUSP8USP50 : 50 494 018–50 546 708, brin inverseUSP50TRPM7 : 50 552 473–50 686 845, brin inverseTRPM7 : 50 648 802–50 686 717, brin inverseSPPL2A : 50 702 266–50 765 948, brin inverseSPPL2ASchéma de HDC : 12 exons sur le brin inverse du chromosome 15Exon 12 : 50 241 947–50 243 006, 1 060 basesExon 11 : 50 243 143–50 243 244, 102 basesExon 10 : 50 248 245–50 248 343, 99 basesExon 9 : 50 252 430–50 252 520, 91 basesExon 8 : 50 252 612–50 252 774, 163 basesExon 7 : 50 253 600–50 253 666, 67 basesExon 6 : 50 254 130–50 254 273, 144 basesExon 5 : 50 254 530–50 254 664, 135 basesExon 4 : 50 257 425–50 257 547, 123 basesExon 3 : 50 258 404–50 258 517, 114 basesExon 2 : 50 263 235–50 263 407, 173 basesExon 1 : 50 265 593–50 265 726, 134 bases1210864215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 2,4 kb sur les 23,8 kb du gène ; 1 989 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit HDC

2

positions dans HDC où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 23,8 kb de HDC, introns compris, et pas seulement les 2,4 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène HDC : histidine decarboxylase. Consulté le 16 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/hdc

Vancouver

Dante Labs. Gène HDC : histidine decarboxylase [Internet]. [consulté le 16 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/hdc

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