Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

COL23A1

collagen type XXIII alpha 1 chain

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
5q35.3
Koordinaadid
Kromosoom 5: 178 237 618–178 590 393 (GRCh38)
Eksonid
29 eksonit, ulatus 352,8 kb
Valk
540 aminohapet
Tuntud ka kui
DKFZp434K0621
MANE Select transkript
ENST00000390654.8NM_173465.4
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni COL23A1 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas COL23A1 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 5, millel on sulg kohal, kus asub COL23A1. COL23A1 ja sellele lähedal asuvad 15 geeni kromosoomil 5, vahemikus 177 884 842 kuni 178 943 169.Kromosoom 55q35.3p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.3178 Mb178,2 Mb178,4 Mb178,6 Mb178,8 MbPROP1: 177 992 235–177 996 242, pöördne ahelPROP1FAM153CP: 178 006 348–178 086 529, otsene ahelFAM153CPN4BP3: 178 113 167–178 127 034, otsene ahelN4BP3RMND5B: 178 129 068–178 152 762, otsene ahelRMND5BNHP2: 178 139 872–178 153 968, pöördne ahelNHP2GMCL2: 178 184 505–178 187 371, pöördne ahelGMCL2HNRNPAB: 178 204 479–178 216 389, otsene ahelHNRNPABPHYKPL: 178 207 127–178 233 208, pöördne ahelPHYKPLCOL23A1: 178 237 618–178 590 393, pöördne ahelCOL23A1CLK4: 178 602 659–178 630 615, pöördne ahelCLK4MSANTD5: 178 694 559–178 697 761, pöördne ahelMSANTD5: 178 694 605–178 729 335, pöördne ahelZNF354A: 178 711 510–178 732 381, pöördne ahelZNF354AZNF354B: 178 859 925–178 889 464, otsene ahelZNF354BZFP2: 178 895 889–178 933 415, otsene ahelZFP2ZNF454: 178 940 827–178 966 649, otsene ahelZNF454COL23A1 skeem: 29 eksonit kromosoomi 5 pöördne ahelalEkson 29: 178 237 618–178 238 700, 1083 alustEkson 28: 178 239 141–178 239 179, 39 alustEkson 27: 178 242 042–178 242 128, 87 alustEkson 26: 178 242 341–178 242 394, 54 alustEkson 25: 178 245 942–178 245 968, 27 alustEkson 24: 178 246 254–178 246 307, 54 alustEkson 23: 178 246 391–178 246 453, 63 alustEkson 22: 178 247 526–178 247 552, 27 alustEkson 21: 178 247 775–178 247 831, 57 alustEkson 20: 178 248 192–178 248 254, 63 alustEkson 19: 178 249 117–178 249 206, 90 alustEkson 18: 178 250 061–178 250 105, 45 alustEkson 17: 178 252 544–178 252 597, 54 alustEkson 16: 178 254 949–178 255 026, 78 alustEkson 15: 178 256 353–178 256 397, 45 alustEkson 14: 178 256 866–178 256 928, 63 alustEkson 13: 178 257 523–178 257 567, 45 alustEkson 12: 178 259 721–178 259 747, 27 alustEkson 11: 178 261 722–178 261 748, 27 alustEkson 10: 178 262 217–178 262 252, 36 alustEkson 9: 178 263 208–178 263 324, 117 alustEkson 8: 178 267 307–178 267 333, 27 alustEkson 7: 178 268 730–178 268 756, 27 alustEkson 6: 178 270 337–178 270 363, 27 alustEkson 5: 178 288 324–178 288 350, 27 alustEkson 4: 178 290 362–178 290 369, 8 alustEkson 3: 178 306 875–178 306 919, 45 alustEkson 2: 178 560 682–178 560 748, 67 alustEkson 1: 178 589 904–178 590 393, 490 alust29201015′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 2,9 kb kogupikkusega 352,8 kb; neist 1623 alust kodeerivad valku.

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). COL23A1 geen: collagen type XXIII alpha 1 chain. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/col23a1

Vancouver

Dante Labs. COL23A1 geen: collagen type XXIII alpha 1 chain [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/col23a1

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test