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Gene

COL23A1

collagen type XXIII alpha 1 chain

Sintesi

Localizzazione citogenetica
5q35.3
Coordinate
Cromosoma 5: 178.237.618–178.590.393 (GRCh38)
Esoni
29 esoni su 352,8 kb
Proteina
540 amminoacidi
Noto anche come
DKFZp434K0621
Trascritto MANE Select
ENST00000390654.8NM_173465.4
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

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Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora COL23A1. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di COL23A1

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 5, con una parentesi dove si trova COL23A1. COL23A1 e 15 geni nelle vicinanze sul cromosoma 5, da 177.884.842 a 178.943.169.Cromosoma 55q35.3p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.3178 Mb178,2 Mb178,4 Mb178,6 Mb178,8 MbPROP1: 177.992.235–177.996.242, filamento inversoPROP1FAM153CP: 178.006.348–178.086.529, filamento direttoFAM153CPN4BP3: 178.113.167–178.127.034, filamento direttoN4BP3RMND5B: 178.129.068–178.152.762, filamento direttoRMND5BNHP2: 178.139.872–178.153.968, filamento inversoNHP2GMCL2: 178.184.505–178.187.371, filamento inversoGMCL2HNRNPAB: 178.204.479–178.216.389, filamento direttoHNRNPABPHYKPL: 178.207.127–178.233.208, filamento inversoPHYKPLCOL23A1: 178.237.618–178.590.393, filamento inversoCOL23A1CLK4: 178.602.659–178.630.615, filamento inversoCLK4MSANTD5: 178.694.559–178.697.761, filamento inversoMSANTD5: 178.694.605–178.729.335, filamento inversoZNF354A: 178.711.510–178.732.381, filamento inversoZNF354AZNF354B: 178.859.925–178.889.464, filamento direttoZNF354BZFP2: 178.895.889–178.933.415, filamento direttoZFP2ZNF454: 178.940.827–178.966.649, filamento direttoZNF454Diagramma di COL23A1: 29 esoni sul filamento inverso del cromosoma 5Esone 29: 178.237.618–178.238.700, 1083 basiEsone 28: 178.239.141–178.239.179, 39 basiEsone 27: 178.242.042–178.242.128, 87 basiEsone 26: 178.242.341–178.242.394, 54 basiEsone 25: 178.245.942–178.245.968, 27 basiEsone 24: 178.246.254–178.246.307, 54 basiEsone 23: 178.246.391–178.246.453, 63 basiEsone 22: 178.247.526–178.247.552, 27 basiEsone 21: 178.247.775–178.247.831, 57 basiEsone 20: 178.248.192–178.248.254, 63 basiEsone 19: 178.249.117–178.249.206, 90 basiEsone 18: 178.250.061–178.250.105, 45 basiEsone 17: 178.252.544–178.252.597, 54 basiEsone 16: 178.254.949–178.255.026, 78 basiEsone 15: 178.256.353–178.256.397, 45 basiEsone 14: 178.256.866–178.256.928, 63 basiEsone 13: 178.257.523–178.257.567, 45 basiEsone 12: 178.259.721–178.259.747, 27 basiEsone 11: 178.261.722–178.261.748, 27 basiEsone 10: 178.262.217–178.262.252, 36 basiEsone 9: 178.263.208–178.263.324, 117 basiEsone 8: 178.267.307–178.267.333, 27 basiEsone 7: 178.268.730–178.268.756, 27 basiEsone 6: 178.270.337–178.270.363, 27 basiEsone 5: 178.288.324–178.288.350, 27 basiEsone 4: 178.290.362–178.290.369, 8 basiEsone 3: 178.306.875–178.306.919, 45 basiEsone 2: 178.560.682–178.560.748, 67 basiEsone 1: 178.589.904–178.590.393, 490 basi29201015′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 2,9 kb dei 352,8 kb del gene; 1623 di queste basi codificano la proteina.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.

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Dante Labs. (s.d.). Gene COL23A1: collagen type XXIII alpha 1 chain. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/col23a1

Vancouver

Dante Labs. Gene COL23A1: collagen type XXIII alpha 1 chain [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/col23a1

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