Přejít na obsah
Použijte své prostředky HSA nebo FSA
Zosekvenujte si svůj genom (otevře se na nové kartě)

Gen

COL23A1

collagen type XXIII alpha 1 chain

Shrnutí

Cytogenetická poloha
5q35.3
Souřadnice
Chromozom 5: 178 237 618–178 590 393 (GRCh38)
Exony
29 exonů na 352,8 kb
Protein
540 aminokyselin
Další názvy
DKFZp434K0621
Transkript MANE Select
ENST00000390654.8NM_173465.4
Typ lokusu
gene with protein product
  • Velmi vysoká
  • Jistá
  • Nízká
  • Velmi nízká

Kurátorované reporty související s tímto genem

Zatím žádná zpráva Genome Test nečte gen COL23A1. Test sekvenuje celý váš genom, takže jsou vaše data přesto obsahují.

Jak je COL23A1 uspořádán

  • Kódující sekvence
  • Netranslatovaná oblast
  • Intron
  • Směr transkripce
  • Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Chromozom 5, se závorkou u COL23A1. COL23A1 a 15 genů poblíž na chromozomu 5, od 177 884 842 do 178 943 169.Chromozom 55q35.3p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.3178 Mb178,2 Mb178,4 Mb178,6 Mb178,8 MbPROP1: 177 992 235–177 996 242, řetězec zpětnémPROP1FAM153CP: 178 006 348–178 086 529, řetězec dopřednémFAM153CPN4BP3: 178 113 167–178 127 034, řetězec dopřednémN4BP3RMND5B: 178 129 068–178 152 762, řetězec dopřednémRMND5BNHP2: 178 139 872–178 153 968, řetězec zpětnémNHP2GMCL2: 178 184 505–178 187 371, řetězec zpětnémGMCL2HNRNPAB: 178 204 479–178 216 389, řetězec dopřednémHNRNPABPHYKPL: 178 207 127–178 233 208, řetězec zpětnémPHYKPLCOL23A1: 178 237 618–178 590 393, řetězec zpětnémCOL23A1CLK4: 178 602 659–178 630 615, řetězec zpětnémCLK4MSANTD5: 178 694 559–178 697 761, řetězec zpětnémMSANTD5: 178 694 605–178 729 335, řetězec zpětnémZNF354A: 178 711 510–178 732 381, řetězec zpětnémZNF354AZNF354B: 178 859 925–178 889 464, řetězec dopřednémZNF354BZFP2: 178 895 889–178 933 415, řetězec dopřednémZFP2ZNF454: 178 940 827–178 966 649, řetězec dopřednémZNF454Schéma COL23A1: 29 exonů na zpětném řetězci chromozomu 5Exon 29: 178 237 618–178 238 700, 1 083 bázíExon 28: 178 239 141–178 239 179, 39 bázíExon 27: 178 242 042–178 242 128, 87 bázíExon 26: 178 242 341–178 242 394, 54 bázíExon 25: 178 245 942–178 245 968, 27 bázíExon 24: 178 246 254–178 246 307, 54 bázíExon 23: 178 246 391–178 246 453, 63 bázíExon 22: 178 247 526–178 247 552, 27 bázíExon 21: 178 247 775–178 247 831, 57 bázíExon 20: 178 248 192–178 248 254, 63 bázíExon 19: 178 249 117–178 249 206, 90 bázíExon 18: 178 250 061–178 250 105, 45 bázíExon 17: 178 252 544–178 252 597, 54 bázíExon 16: 178 254 949–178 255 026, 78 bázíExon 15: 178 256 353–178 256 397, 45 bázíExon 14: 178 256 866–178 256 928, 63 bázíExon 13: 178 257 523–178 257 567, 45 bázíExon 12: 178 259 721–178 259 747, 27 bázíExon 11: 178 261 722–178 261 748, 27 bázíExon 10: 178 262 217–178 262 252, 36 bázíExon 9: 178 263 208–178 263 324, 117 bázíExon 8: 178 267 307–178 267 333, 27 bázíExon 7: 178 268 730–178 268 756, 27 bázíExon 6: 178 270 337–178 270 363, 27 bázíExon 5: 178 288 324–178 288 350, 27 bázíExon 4: 178 290 362–178 290 369, 8 bázíExon 3: 178 306 875–178 306 919, 45 bázíExon 2: 178 560 682–178 560 748, 67 bázíExon 1: 178 589 904–178 590 393, 490 bází29201015′3′

Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.

Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.

Exony tvoří 2,9 kb z 352,8 kb genu; 1 623 těchto bází kódují protein.

Externí odkazy

Odkud údaje pocházejí

  • HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
  • MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.

Citovat tuto stránku

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen COL23A1: collagen type XXIII alpha 1 chain. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/col23a1

Vancouver

Dante Labs. Gen COL23A1: collagen type XXIII alpha 1 chain [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/col23a1

Jeden test. Odpovědi na celý život.

Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů

Objednejte si Genome Test