Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi
Sekvensoi genomisi (avautuu uuteen välilehteen)

Geeni

COL23A1

collagen type XXIII alpha 1 chain

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
5q35.3
Koordinaatit
Kromosomi 5: 178 237 618–178 590 393 (GRCh38)
Eksonit
29 eksonia 352,8 kb:n alueella
Proteiini
540 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
DKFZp434K0621
MANE Select -transkripti
ENST00000390654.8NM_173465.4
Lokustyyppi
gene with protein product
  • Erittäin korkea
  • Varma
  • Matala
  • Erittäin matala

Tähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja

Mikään Genome Test -raportti ei vielä lue geeniä COL23A1. Testi sekvensoi koko genomisi, joten tiedoissasi on se silti.

COL23A1-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 5, jossa hakasulke osoittaa COL23A1-geenin sijainnin. COL23A1 ja 15 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 5, välillä 177 884 842–178 943 169.Kromosomi 55q35.3p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.3178 Mb178,2 Mb178,4 Mb178,6 Mb178,8 MbPROP1: 177 992 235–177 996 242, juoste taaksepäinPROP1FAM153CP: 178 006 348–178 086 529, juoste eteenpäinFAM153CPN4BP3: 178 113 167–178 127 034, juoste eteenpäinN4BP3RMND5B: 178 129 068–178 152 762, juoste eteenpäinRMND5BNHP2: 178 139 872–178 153 968, juoste taaksepäinNHP2GMCL2: 178 184 505–178 187 371, juoste taaksepäinGMCL2HNRNPAB: 178 204 479–178 216 389, juoste eteenpäinHNRNPABPHYKPL: 178 207 127–178 233 208, juoste taaksepäinPHYKPLCOL23A1: 178 237 618–178 590 393, juoste taaksepäinCOL23A1CLK4: 178 602 659–178 630 615, juoste taaksepäinCLK4MSANTD5: 178 694 559–178 697 761, juoste taaksepäinMSANTD5: 178 694 605–178 729 335, juoste taaksepäinZNF354A: 178 711 510–178 732 381, juoste taaksepäinZNF354AZNF354B: 178 859 925–178 889 464, juoste eteenpäinZNF354BZFP2: 178 895 889–178 933 415, juoste eteenpäinZFP2ZNF454: 178 940 827–178 966 649, juoste eteenpäinZNF454COL23A1-kaavio: 29 eksonia kromosomin 5 juosteella, taaksepäinEkson 29: 178 237 618–178 238 700, 1 083 emästäEkson 28: 178 239 141–178 239 179, 39 emästäEkson 27: 178 242 042–178 242 128, 87 emästäEkson 26: 178 242 341–178 242 394, 54 emästäEkson 25: 178 245 942–178 245 968, 27 emästäEkson 24: 178 246 254–178 246 307, 54 emästäEkson 23: 178 246 391–178 246 453, 63 emästäEkson 22: 178 247 526–178 247 552, 27 emästäEkson 21: 178 247 775–178 247 831, 57 emästäEkson 20: 178 248 192–178 248 254, 63 emästäEkson 19: 178 249 117–178 249 206, 90 emästäEkson 18: 178 250 061–178 250 105, 45 emästäEkson 17: 178 252 544–178 252 597, 54 emästäEkson 16: 178 254 949–178 255 026, 78 emästäEkson 15: 178 256 353–178 256 397, 45 emästäEkson 14: 178 256 866–178 256 928, 63 emästäEkson 13: 178 257 523–178 257 567, 45 emästäEkson 12: 178 259 721–178 259 747, 27 emästäEkson 11: 178 261 722–178 261 748, 27 emästäEkson 10: 178 262 217–178 262 252, 36 emästäEkson 9: 178 263 208–178 263 324, 117 emästäEkson 8: 178 267 307–178 267 333, 27 emästäEkson 7: 178 268 730–178 268 756, 27 emästäEkson 6: 178 270 337–178 270 363, 27 emästäEkson 5: 178 288 324–178 288 350, 27 emästäEkson 4: 178 290 362–178 290 369, 8 emästäEkson 3: 178 306 875–178 306 919, 45 emästäEkson 2: 178 560 682–178 560 748, 67 emästäEkson 1: 178 589 904–178 590 393, 490 emästä29201015′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 2,9 kb geenin 352,8 kb:stä; 1 623 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

Ulkoiset linkit

Mistä tieto on peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). COL23A1-geeni: collagen type XXIII alpha 1 chain. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/col23a1

Vancouver

Dante Labs. COL23A1-geeni: collagen type XXIII alpha 1 chain [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/col23a1

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test