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Gen

COL23A1

collagen type XXIII alpha 1 chain

Resumen

Localización citogenética
5q35.3
Coordenadas
Cromosoma 5: 178.237.618–178.590.393 (GRCh38)
Exones
29 exones en 352,8 kb
Proteína
540 aminoácidos
También conocido como
DKFZp434K0621
Transcrito MANE Select
ENST00000390654.8NM_173465.4
Tipo de locus
gene with protein product
  • Muy alta
  • Alta
  • Baja
  • Muy baja

Genoma de referenciaGRCh38

Las posiciones en las páginas de genes y variantes siguen esta elección, en este navegador.

Informes revisados relevantes para este gen

Ningún informe de Genome Test lee aún COL23A1. La prueba secuencia todo su genoma, así que sus datos lo incluyen igualmente.

Estructura de COL23A1

  • Secuencia codificante
  • Región no traducida
  • Intrón
  • Sentido de la transcripción
  • Regiones que las lecturas cortas tienen dificultad para leer
Cromosoma 5, con un corchete donde se ubica COL23A1. COL23A1 y 15 genes cercanos en el cromosoma 5, desde 177.884.842 hasta 178.943.169.Cromosoma 55q35.3p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.3178 Mb178,2 Mb178,4 Mb178,6 Mb178,8 MbPROP1: 177.992.235–177.996.242, hebra inversaPROP1FAM153CP: 178.006.348–178.086.529, hebra directaFAM153CPN4BP3: 178.113.167–178.127.034, hebra directaN4BP3RMND5B: 178.129.068–178.152.762, hebra directaRMND5BNHP2: 178.139.872–178.153.968, hebra inversaNHP2GMCL2: 178.184.505–178.187.371, hebra inversaGMCL2HNRNPAB: 178.204.479–178.216.389, hebra directaHNRNPABPHYKPL: 178.207.127–178.233.208, hebra inversaPHYKPLCOL23A1: 178.237.618–178.590.393, hebra inversaCOL23A1CLK4: 178.602.659–178.630.615, hebra inversaCLK4MSANTD5: 178.694.559–178.697.761, hebra inversaMSANTD5: 178.694.605–178.729.335, hebra inversaZNF354A: 178.711.510–178.732.381, hebra inversaZNF354AZNF354B: 178.859.925–178.889.464, hebra directaZNF354BZFP2: 178.895.889–178.933.415, hebra directaZFP2ZNF454: 178.940.827–178.966.649, hebra directaZNF454Diagrama de COL23A1: 29 exones en la hebra inversa del cromosoma 5Exón 29: 178.237.618–178.238.700, 1083 basesExón 28: 178.239.141–178.239.179, 39 basesExón 27: 178.242.042–178.242.128, 87 basesExón 26: 178.242.341–178.242.394, 54 basesExón 25: 178.245.942–178.245.968, 27 basesExón 24: 178.246.254–178.246.307, 54 basesExón 23: 178.246.391–178.246.453, 63 basesExón 22: 178.247.526–178.247.552, 27 basesExón 21: 178.247.775–178.247.831, 57 basesExón 20: 178.248.192–178.248.254, 63 basesExón 19: 178.249.117–178.249.206, 90 basesExón 18: 178.250.061–178.250.105, 45 basesExón 17: 178.252.544–178.252.597, 54 basesExón 16: 178.254.949–178.255.026, 78 basesExón 15: 178.256.353–178.256.397, 45 basesExón 14: 178.256.866–178.256.928, 63 basesExón 13: 178.257.523–178.257.567, 45 basesExón 12: 178.259.721–178.259.747, 27 basesExón 11: 178.261.722–178.261.748, 27 basesExón 10: 178.262.217–178.262.252, 36 basesExón 9: 178.263.208–178.263.324, 117 basesExón 8: 178.267.307–178.267.333, 27 basesExón 7: 178.268.730–178.268.756, 27 basesExón 6: 178.270.337–178.270.363, 27 basesExón 5: 178.288.324–178.288.350, 27 basesExón 4: 178.290.362–178.290.369, 8 basesExón 3: 178.306.875–178.306.919, 45 basesExón 2: 178.560.682–178.560.748, 67 basesExón 1: 178.589.904–178.590.393, 490 bases29201015′3′

Exones del transcrito MANE Select del gen (versión v1.5), de NCBI y EMBL-EBI, sobre el genoma de referencia GRCh38.

Bandas cromosómicas del ideograma GRCh38 de UCSC (2022-10-29).

Genes cercanos de Ensembl, versión 116, en GRCh38.

Los exones suman 2,9 kb de los 352,8 kb del gen; 1623 de esas bases codifican la proteína.

Origen de estos datos

  • HGNC: el símbolo del gen, su nombre, otros símbolos y su ubicación.
  • MANE Select v1.5, de NCBI y EMBL-EBI: el transcrito, sus exones y la secuencia codificante.

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APA

Dante Labs. (s. f.). Gen COL23A1: collagen type XXIII alpha 1 chain. Consultado el 17 de octubre de 2026, en https://dantelabs.com/es/genes/col23a1

Vancouver

Dante Labs. Gen COL23A1: collagen type XXIII alpha 1 chain [Internet]. [citado 17 de octubre de 2026]. Disponible en: https://dantelabs.com/es/genes/col23a1

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